1、从消毒效果来说，碘伏和酒精（75%医用酒精）都是可靠的。
2、碘伏的刺激性比酒精小。
3、使用碘伏消毒，在伤口痊愈后，可能会有留下痕迹的风险。因此，如果伤口在暴露部位，如面部、手等，建议使用75%医用酒精。
一、酒精消毒原理：
酒精是一种有机化合物，学名叫乙醇，分子式为C2H5OH。酒精的分子具有很大的渗透能力，它能穿过细菌表面的膜，打入细菌的内部，使构成细菌生命基础的蛋白质凝固(蛋白质变性)，将细菌杀死。照这样说来，要使酒精的杀菌消毒效果好，当然是酒精越浓越好了。然而奇怪的是，纯酒精反而不能彻底杀死病菌。这是为什么呢?
原来，浓度几乎达到100％的纯酒精使蛋白质凝固的本领固然很大，但是它却使细菌表面的蛋白质一下子就凝固起来，形成了一层硬膜。这层硬膜阻止酒精分子进一步渗入细菌内部，反而保护了细菌，使它免遭死亡。在纯酒精中搀入一定量的水以后，酒精就不会使细菌表面的蛋白质一下子凝固，于是大量酒精分子钻进到细菌体内，使其中的蛋白质都凝固起来，细菌就难逃一死了。人们经过反复的试验，知道浓度为75％的酒精杀菌力最强，所以医用消毒酒精一般都是含75％的纯酒精和25％的水。
二、碘伏消毒原理：
碘伏是单质碘与聚乙烯吡咯酮的不定型结合物。聚乙烯吡咯酮可溶解分散9%~12%的碘，此时呈现紫黑色液体。但医用碘伏通常浓度较低（1%或以下），呈现浅棕色。碘伏具有广谱杀菌作用，可杀灭细菌繁殖体、芽孢、真菌、原虫和部分病毒。在医疗上用作杀菌消毒剂，可用于皮肤、粘膜的消毒，也可处理烫伤、治疗滴虫性阴道炎、霉菌性阴道炎、皮肤霉菌感染等。也可用于手术前手和其它皮肤的消毒手、各种注射部位皮肤消毒、器械浸泡消毒以及阴道手术前消毒等。适用于皮肤、手、粘膜消毒，粘膜消毒仅限于医疗卫生机构诊疗前后使用。
三、碘伏和酒精消毒的不同作用：
酒精为中效消毒剂，通过使菌体蛋白凝固变性而发挥消毒作用。临床常用75%溶液作为消毒剂滴入牵引针眼用于预防针眼感染。但酒精滴入针眼的方法消毒范围较有限，且酒精易挥发，不稳定；对皮肤粘膜有刺激性，故可引起患者疼痛等不适感。碘伏亦属中效消毒剂，与酒精相比较，具有下列特点： 碘伏是碘与表面活性剂结合而成的不稳定结合物，表面活性 剂起超载体与助溶作用。碘与菌体蛋白质中的氨基酸结合使其变性，并在治疗创面形成极薄杀菌膜，缓慢持久地释放有效碘，对各类细菌、芽胞、病毒、真菌、原虫均有较强的杀菌作用。 碘伏性质温和，无毒、无味、无致敏性，对粘膜无刺激性，还有清洁作用，具有速效，稳定性好等特点。 碘伏对铜、铝、碳钢等二价金属有腐蚀性，但目前临床骨牵引使用的克氏针、斯氏针及颅骨牵引弓等均为不锈钢制品，具有抗腐蚀性强的特点，因此使用碘伏消毒牵引针眼是安全的。 碘伏受有机物影响大,脓血等有机物存在可降低其杀菌效果,因此，消毒时若针眼处有分泌物或结痂时，应先用棉签拭去，以免发生痂下积脓，并可使碘伏充分发挥消毒效果。