宁玛派，俗称红教，
宁玛派将佛法分为九乘，尤其重视阿底瑜伽乘，即俗称的大圆满法，提倡一切现象原始清净圆满的见地。
在传承方式上，比较重视伏藏传承，即前弘期由莲师所埋藏的密法经典。重要的传承师包括三素尔、龙钦巴、德达林巴、蒋扬钦哲、局米旁等，主要寺院有藏区的敏珠林寺、多吉扎寺和康区的
噶陀寺、白玉寺、佐钦寺。
格鲁派，俗称黄教，
14世纪青海高僧
宗喀巴广学流传于藏区的一切教法，并进行系统严密的组织，尤其强调戒律，因此格鲁派僧人都戴象征戒律的黄帽。
此派在显教方面，主张依次第遍学一切佛法，见地上依据中观应成派，密法方面，比较推崇后弘期所传的密集、胜乐、怖畏等密续以及秘密不共的温萨耳传。重要寺院有甘丹寺、哲蚌寺、色拉寺、
扎什伦布寺、塔尔寺、
拉卜楞寺等。
两派主要区别在于密法修行的方便，以及空性的见地。
黑教是西藏的本土宗教。正式名称
苯教或者“苯巴教”。在佛教传入前，藏族几乎人人都信奉苯教。宁玛派（红教）的很多仪式就是借鉴苯教的。佛教成为主流宗教后，苯教势力越来越萎缩，但在西藏北部仍有信奉者。
花教即
藏传佛教的萨迦派。萨迦派比较注重“道果法”的修行。道果法就是加深自己对因果报应的理解，以获得解脱的一种修行方法。