土壤测试也能帮助揭示营养问题的原因，当作为叶分析的补充时，土壤测试最有价值。3月初或采收后取样，对土壤相对一致面积不大的果园取12点，采样点定在树冠外缘4个点、树干距树冠2/3处4个点、行间4个点（按照根系分布的百分比取土样）。普通土样用土钻垂直采集，微量元素土样的采集与普通土样同步进行，采样时避免使用铁、铜等金属器具。
普通土样采集1千克左右，微量元素土样采集1.5千克左右，采样深度0～100厘米，每20厘米为一层，且上下层采集数量相等。样品经过风干、粉碎、过筛后，用四分法提取一部分，过0.25毫米筛（过筛孔径根据测定项目定），留取样品不超过200克。
通过果园土壤分析，掌握土壤养分的丰缺程度，作为确定施肥种类和数量的重要参考。