总体来讲，地面危害鼠春季鼠密度达到3%（或平均每公顷有效鼠洞在15个以上）、秋季鼠密度达到5%（或平均每公顷的有效鼠洞在20个以上）时，需要开展灭鼠；对鼢鼠等危害地下根茎的鼠类，其鼠密度平均每公顷在3只以上即需要开展灭鼠。在苗圃及高经济作物区，开展灭鼠的指标应在鼠密度1%～2%之间。
灭鼠的经济指标是动态的，它随着作物产量、产品价格、灭鼠费用及效果等不同而改变。因此，不同的生产水平、不同的灭鼠措施都会引起灭鼠指标及适期的变化，故在农业生产上，要因地制宜，视具体情况，灵活掌握。同时，各地的鼠种构成不同对灭鼠指标也有影响，体型大的鼠种活动性强、食量大、造成损失大。因此，在制定灭鼠指标时，必须了解本地区的鼠种组成，也便于选择对路药剂。