想要弄清楚这个问题，首先就要说说以色列这个国家；以色列从建国初期就面临着强敌如林的境地。这个国家基本上没有和平的日子这一说。所以以色列的军事实力是非常强大的，而且奉行优先打击高威胁目标的国防策略。只要是对以色列不友好的国家，部署了能威胁到以色列的武器，以色列总是直接打击。
由于伊朗属于穆斯林国家，本身就和以色列关系恶劣。而在之前伊朗还发射了火箭弹袭击以色列境内的大量目标，虽然一部分被以色列的铁穹系统拦截，但是还是给以色列造成了一定的伤亡和损失。所以以色列这次空袭叙利亚主要针对的目标就是叙利亚境内的伊朗伊斯兰革命卫队。
其次是作为美国在中东最重要的盟友和棋子，以色列这次打击伊朗多少有点美国在背后指使的意思，毕竟因为伊朗的核问题，美国和伊朗之间的关系已经恶化了。这次的空袭很有可能是美国借助以色列之手敲打伊朗。
最后的原因就是从阿拉伯之春以来，全中东的反以势力齐聚叙利亚，以色列从原来的被南北夹击变成了现在三面楚歌的境地。这些威胁严重危及了以色列的领土完整和国家安全。以色列这次空袭行动也展现出了以色列的国防力量，震慑了这些反以势力。
综上所述，以色列的核心并不是反恐打击ISIS，而是用这个接口打击伊朗，伊朗军方对此强烈不满也就不难理解了。
主要是因为伊朗政府和叙利亚巴沙尔政府同属于什叶派，而且以色列和伊朗政府一直是世仇的状态。一旦巴沙尔政府被推翻，那么以色列将会和伊朗直接接壤。这是伊朗绝对不愿意看到的。而且伊朗将叙利亚作为自身在中东影响力扩大的一个大据点。所以伊朗军方才会表达强烈的不满。
其实伊朗军方对以色列表达强烈的不满，其实有两点原因。第1点就是为了保住巴沙尔政权。因为巴沙尔和伊朗政府都同属什叶派。而伊朗是全世界最大的什叶派国家。所以因为宗教原因，必须要保住巴沙尔政权。第2点就是威慑骚扰以色列。伊朗与以色列相互视对方为最大敌人，可谓深仇大恨。叙利亚与以色列接壤，伊朗驻军叙利亚就占据了绝佳的地理区位去侵扰以色列。
当然以色列和伊朗之间发生矛盾，但是我们都清楚，他们只不过是棋子，而背后的支持者，就是俄罗斯和美国这两个国家。因为以色列的背后是强大的美国，而且美国对于以色列的支持，几乎可以说是毫无保留的。所以因为有美国的因素，伊朗军方就是表达强烈不满，但是他也仅仅只能这样做。因为他无法和以色列还有美国对抗。
虽然伊朗的背后有着俄罗斯的支持，但是和美国以色列这样紧密的关系相比，伊朗和俄罗斯这两个国家的亲密程度远远差的太多。而且俄罗斯只是为了帮助自己，不会帮助伊朗做任何事也不会帮助伊朗维护自己本土的安全。所以伊朗军方只能表达抗议。当然除此之外，地区性的大国也不可能让伊朗来对付以色列，因为那样的话，伊朗就会成为中东的霸主。这是其他的地区大国不愿意看到的。