1、第7集每月一件礼物威胁事件
小川医生从两年前开始每个月都收到现金和礼物来拜托小五郎查出是谁在恶作剧。之后小川医生的儿子被绑架了。另一方面兰开始怀疑柯南就是新一……
2、第96集走投无路的名侦探 连续两大杀人事件
魔术师九十九元康的妻子来到了小五郎的事务所。她觉得1个星期前被认为是自杀的丈夫是不可能自杀的，希望小五郎尽快调查现场……。柯南在那里看到了有暗号的memo和被牌遮住的电话推理出了真正的犯人。
兰在看到以前的影集时发现柯南和新一小时后一模一样。相信柯南就是新一所以把柯南带到了新一家门口！正在这个时候有希子回来了。次日柯南和有希子一起去了有希子的同学薮内家，薮内家正在为了遗产而起纷争……
3、第188集危命的复活 洞窟中的侦探团
和阿笠博士去露营的少年侦探团们。柯南他们去拾柴，发现了一个山洞，进去一看碰到了正在搬运尸体的可疑男子。柯南被犯人的枪射中了。
4、第189集危命的复活 负伤的名侦探
把重伤的柯南背在背上的侦探团们根据洞里的暗号开始寻找出口。好容易找了出口后，犯人追了出来被正好赶来的目暮警官们带走了。柯南被迅速送到了医院。小兰确信了柯南就是新一。 190 危命的复活 第三种选择
5、第191集危命的复活 黑衣骑士
在小兰主演的话剧的表演中，发生了杀人事件。目暮警官认为被杀害的蒲田的饮料中被他的同伴们下了毒，但是从现实情况来说准备断定是自杀。此时出现了意外的人物！ 192 危命的复活 新一回来了
6、第193集危命的复活 约定的场所
新一明白了在米花中心大厦的电梯里杀害社长的犯人，但是身体开始发生变化，另一方面小兰在了望餐厅一个人等着新一的回来。
7、第398集奇妙一家的委托(前篇)
柯南、小兰与小五郎一起同行前往委托人的家中。本次的委托内容是寻找委托人狩谷伴子的手机。委托人伴子的外遇对象将要打来电话，可是手机却不见了颇为困扰，所以委托小五郎进行调查。委托人的继父大策，弟弟滋英，丈夫的嗣贵，都有嫌疑，随后伴子自己找到了手机，随即调查结束。
8、第399集奇妙一家的委托(后篇)
随后，柯南在阿笠博士家看到新闻上正在播出委托人伴子的死讯，画面上出现了她的遗体…狩谷伴子被杀之后。柯南、目暮警部等人来到她的家对事件进行调查.他们从伴子手机已经处于解锁状态判断。
这很有可能犯人有关.这个密码需要1万次左右才能被破解。从这点来看犯人是在自己的屋内进行尝试破解.目暮等人得知犯案时间在晚上7点半左右。当时不在犯罪现场的大策、滋英、嗣贵都有嫌疑......
9、第400集心存疑惑的兰
近期小兰越加怀疑柯南就是新一。柯南放在那里的手机被小兰给看到，她想从手机的邮件确认自己的怀疑。小兰在开机画面中发现手机被锁定了。正想解除密码暗号的时候，外面有汽车喇叭的相声，小兰看到那车的号码是46-49（yoroshiku），想起半年前与新一约会的事情…...
096 走投无路的名侦探 连续两大杀人事件
188 危命的复活 洞窟中的侦探团
189 危命的复活 负伤的名侦探
190 危命的复活 第三种选择
191 危命的复活 黑衣骑士
192 危命的复活 新一回来了
193 危命的复活 约定的场所
398 奇妙一家的委托(前篇)
399 奇妙一家的委托(后篇)
400 心存疑惑的兰
剧场版3 世纪末的魔术师
这些集数有怀疑，不过最后都没有被发现