在治疗慢性胃炎时，幽门螺杆菌的根除是一个重要步骤。根据2006年中国慢性胃炎共识意见，建议针对以下情况实施根除：胃黏膜存在糜烂、萎缩、肠化生或异型增生的患者；有消化不良症状的患者；以及有胃癌家族史者。常规的根治方案采用三联疗法，如未能成功，可考虑使用含铋剂的四联方案，具体用药需在医生指导下进行。
针对消化不良的症状，治疗通常基于功能性消化不良的经验性疗法。常用的药物包括抑酸药如雷尼替丁或奥美拉唑胶囊，能减轻胃酸过多；促胃肠动力药如多番立酮（吗叮啉）片，有助于改善胃肠道运动；胃黏膜保护药如硫糖铝咀嚼片，有助于保护胃黏膜；中药也可尝试，这些药物不仅针对症状，还能对胃黏膜修复和炎症有所帮助。
对于自身免疫性胃炎，目前尚无特效疗法，但当出现恶性贫血时，可通过注射维生素B12来纠正贫血情况。
异型增生，作为胃癌的癌前病变，需要高度警惕。轻度异型增生除了常规治疗外，定期随访至关重要。重度异型增生则应考虑预防性手术，内镜下胃黏膜切除术是常见的治疗方法。
慢性胃炎（chronic gastritis）是由各种病因引起的胃黏膜慢性炎症。我国属幽门螺杆菌（HP）高感染率国家，估计人群中HP感染率在40%～70%左右。人是目前唯一被确认的HP传染源。60%以上的慢性胃炎患者存在HP感染。HP感染→慢性浅表性胃炎→萎缩性胃炎→肠化生或不典型增生→胃癌。这一发展途径已得到临床验证。一般认为通过人与人之间密切接触的口口或粪口传播是HP的主传播途径。因为HP感染几乎无例外地引起胃黏膜炎症，感染后机体一般难以将其清除而变成慢性感染。