事业单位编内人员和编外人员有以下两点区别：1、事业单位编内人员是正式工，不用签合同，可享受职称工资，职称越高工资越高，可交纳公积金，可升职，还可享受政府发放的各项福利。而事业单位编外人员属临时工，工资标准低，不享受职称工资，有职称也没有用，一般不交纳工积金，不享受政府发放的各项福利。2、稳定性不一样，事业单位编内人员，如果在一个岗位考核不称职，没有犯下特别大的错误，不能辞退，可另外调岗位，而且事业单位辞退人员正规，需要上报上级部门备案。而事业单位编外人员是单位临时雇用，工作需要时就用你，不需要时可随时辞退你。
事业单位工作人员使用的是事业编制，按财政供养分为全额、差额和自收自支编制。现在自收自支编制取消，差额编制范围极小，也就卫生部门及部分有收入的公益类事业单位使用，历培其他大多数事业单位，使用的都是公益一类编制。
事业单位的编外人员，也分为两类，一类是“暂时性非在编人员”，这类人员是正式职工，因为工作调动、机构改革、编制缩减等原因，暂时处于超编状态，不能使用编制。但随着单位在编人员因为调动、退休、死亡等自然减员，腾退出编制后，就可以使用，成为在编人员。这类暂时性非在编人员的工资待遇和晋升、发展等，都和正式职工是一样的，只是有些和编制挂钩的福利、补贴、奖金，以及社保费用缴纳等，可能会受到影响。
另一类编外人员，是事实上的编外人员，指临时工、合同工、劳务派遣工、人事代理等非正式人员。这类人和单位属于聘用关系，永远不能使用编制。其工资待遇，也远远低于正式职工，更不用说什么提拔晋升、前途发展了。除了合同规定的工资收入以外，正式职工所能享受的福利、补贴、奖金等，这类编外人员也无法使用。而且随着事业单位改革，精简机构、人员，第一个被清理的，就是这类人员。正式职工的“铁饭碗”，都随着机构改革变成了“瓷饭碗”，更不用说临时聘用人员了。目前，最不明显的，就是行政执法类事业单位，已经有文件要求全面清退临时工合同工等编外人员了。其他单位也有相同的压力，清理也是时间问题。
