农村合作医疗检查费可以报销，具体的报销比例按不同级数的医院来评定。
法律依据：《国务院办公厅转发卫生部等部门关于建立新型农村合作医疗制度意见的通知》一、目标和原则 新型农村合作医疗制度是由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。从2003年起，各省、自治区、直辖市至少要选择2—3个县(市)先行试点，取得经验后逐步推开。到2010年，实现在全国建立基本覆盖农村居民的新型农村合作医疗制度的目标，减轻农民因疾病带来的经济负担，提高农民健康水平。