组织的采集：
通常用于测序的植物DNA材料采集时，应选择当年生、新鲜且幼嫩（近成熟）的健康组织，主要采集叶片，但也可根据实际情况采集其他组织或器官，如芽、花、果实和种子等。每份样品采集量应为3-5克（鲜重），若为叶片，其表面积不应小于50平方厘米（约等于成年人手掌面积）。为保持DNA材料的稳定性，建议将每份DNA材料分为两份进行保存。采集后，应将新鲜的植物DNA材料迅速放入液氮中，或使用带有冷藏功能的采集箱，直至运输回实验室。回实验室后，应将DNA材料存于液氮或-80℃超低温环境中，无需干燥，可长期保存（2年内需进行检查）。
组织的干燥保存：
在野外作业中，使用液氮或采集箱保存DNA材料可能不便，因此，干燥保存方法尤为重要。将新鲜的植物DNA材料置于柔软且透气性好的纸袋中进行干燥。此方法可防止植物叶片在干燥过程中因脆化而破碎，同时避免与硅胶混杂，减少样品间的交叉污染。如无此类纸袋，可使用塑料自封袋代替，但需将植物DNA材料与硅胶一同干燥。
对于易失水的植物DNA材料，应在野外采集后立即进行快速干燥；对于不易失水的植物遗传物质材料，可在采集后放置一段时间（直至叶片失水前），再进行干燥；对于难以用硅胶快速干燥的遗传物质材料，如较厚或具多浆的叶片或种子等，可将这些材料碎成小片（块）后用硅胶快速干燥。
快速干燥植物DNA材料的最佳方式是使用硅胶，它能在短时间内使植物材料快速脱水，且对DNA的损伤较小。硅胶有粉末状（直径为20～30Å）和变色硅胶（蓝色）两种类型，混合使用效果更佳。通常需放入足够的硅胶（使硅胶覆盖全部的遗传物质材料）进行快速干燥。
组织的保存：
植物组织在干燥处理后或除野外采集过程外，均需置于合适的环境中保存。理想的环境条件为温度（4-15℃）和湿度（相对湿度小于10%-30%）。如无相应保存条件，可在室温下保存，但需保持通风干燥的环境；植物DNA材料也可以在低温（-20℃）或超低温（-80℃）条件下保存，但需保持DNA材料的干燥状态。然而，在这些条件下，植物DNA材料（如叶片等）实际上很难长期保存。因此，保存总DNA是另一种策略。
总DNA的保存：
提取总DNA后，应检查其完整性、纯度、浓度和含量。植物总DNA的保存最佳状态为干粉形式。如以溶液形式保存，应用1 × TE缓冲液稀释，并确保TE缓冲液的pH值在8.0-8.5之间。植物总DNA的低温保存最佳条件为-80℃以下或液氮保存，无条件的情况下也可在-20℃保存。总DNA应避免频繁冻融，并建议每份样品保存3-5个样本。提取后保存的总DNA时限通常较长（超过两年），但若长期保存，每隔两年应进行抽测，对不符合使用要求的DNA进行更新。
RNA的保存：
由于RNA为单链分子，稳定性较差，极易降解，其主要降解原因是内源性核酸酶（RNAase）的作用，其在活体内的存在时间也不长。同时，外源性RNAase也不容忽视，如头发、灰尘、体液、塑料等均存在RNAase。因此，RNA的保存需极其谨慎，提取时应戴帽子、口罩、橡胶无菌手套，并在洁净、灰尘少的地方提取。从组织材料的采集开始，经运输与储存，包括实验的全过程，涉及到RNA的均需将其置于液氮中，以停止细胞生理生化过程，从而较长时间保存RNA。这意味着不仅组织材料需保存于液氮中，实验操作也需保证液氮充足供应。将样品保存于-80℃等均无法有效制止RNA的局部或完全降解。
细胞的保存：
细胞是DNA、RNA的载体，也构成了组织。当涉及专属的细胞学实验时，便需要特殊的方法对其保存，这往往是细胞工程的基础。例如，做单细胞克隆要求细胞具有活力。又如基于某些目的使用流式细胞术分析细胞，此时要确保细胞能够相互分离，通常要求细胞具有活性，糖在细胞内的累积会导致分析不准确。液氮的低温环境（-196℃）是目前最佳的冷冻保存温度，复苏后细胞的结构和功能完好。如果冷冻过程得当，一般生物样品在-196℃下可保存十年以上。应用-80℃保存细胞，短期内对细胞的活性无明显影响，但随着冻存时间延长，细胞存活率明显降低。
不同层次的样品，需根据样品性质、实验目的、保存条件，综合分析，选择最适合的方法。目的样品是分子水平，就需从分子角度考虑组织的保存；细胞水平，则是从细胞角度考虑。不同层次对细胞的活性要求也不同。
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