马更些河流域主要位于北美洲大平原的北部，属于北美中央平原的北部区域，其东部，包括阿萨巴斯卡湖区，是一片古老的丘陵地带。河流上游的左岸支流，如芬利河、斯莫基河和沃巴斯卡河，源自北美洲西部的落基山脉地区。
流域内中央平原部分，被称为马更些低地，海拔普遍低于200米，宽约402公里，这个区域通常被称为森林地带，但覆盖的主要是少量的针叶林、白云杉和黑云杉。远离主要河道的地区则被沼泽、泥炭、湖泊以及大片的野草和低矮灌木所占据。而低地之下则是广阔的沉积岩层。
从地质角度看，马更些河干流的东部和西部在水系发育程度上存在显著差异。东部地势较低，受第四纪大陆冰川影响，水系发育尚未充分，但仍与阿萨巴斯卡湖、大奴湖、大熊湖等湖泊通过水道相连；而西部的落基山脉支流发育较为成熟，主要水源来自冰雪融水。
流域内形成了一系列三角洲地带，如马更些河口三角洲、奴河三角洲以及皮斯一阿萨巴斯卡三角洲，这些地方分布着众多的小支流和湖泊。在加拿大，马更些河三角洲的显著标志是北极圈的标志牌。
马更些河是加拿大第一长河，在北美六大河中仅次于密西西比-密苏里水系。源流阿萨巴斯卡河和皮斯河均源于加拿 大落基山脉东麓。阿萨巴斯卡河向东北注入阿萨巴斯卡湖，出湖后与皮斯河汇合成奴河，向北入大奴湖；出湖后始称马更些河，向西北流，最后入北冰洋波弗特海。