为推动中小企业健康发展，规范专项资金的管理并提升资金利用效率，本办法依据《中华人民共和国预算法》、《中华人民共和国中小企业促进法》及财政预算管理相关规定制定。
专项资金，由中央财政预算提供，主要支持中小企业，尤其是小型微型企业进行技术创新、结构调整、发展模式转变以及扩大就业。这些资金还用于改善服务环境，以促进企业整体发展。
资金分配采用因素法，地方需根据中央财政下达的预算指标，遵循相应的操作要求进行安排使用。中小企业规模的划分依据国家制定的标准。
在专项资金的运用和管理中，必须遵循国家宏观政策、产业政策和区域发展策略，并向中西部地区倾斜。原则包括公开透明、定向使用、科学管理以及强化监督。通过引导社会资金，扩大政策受益范围，确保资金使用规范、安全且效益显著。
专项资金的监管由财政部和工业和信息化部共同负责。财政部负责预算管理与资金拨付，与工业和信息化部共同制定资金分配方案，并对资金使用进行检查。工业和信息化部则与财政部协作，确定年度重点支持领域，发布年度工作通知，设立项目管理系统，审核实施方案，并对项目执行情况进行评价和监督。
根据《中华人民共和国预算法》《中华人民共和国中小企业促进法》和财政预算管理有关规定，2012年5月25日，财政部、工业和信息化部以财企〔2012〕96号印发《中小企业发展专项资金管理办法》。该《办法》分总则，支持内容及方式，申请条件及申报材料，组织申报、审核及资金拨付，监督检查，附则6章31条，自印发之日起施行。《财政部工业和信息化部关于印发〈中小企业发展专项资金管理暂行办法〉的通知》（财企〔2008〕179号）予以废止。