有两个结局，分别是大陆版结局和香港版结局。
1、大陆版结局
双方“内鬼”都认出了自己的身份，不过刘建明抢先一步，已经将陈永仁在警察局的档案删除，但在删除之前，保留了一个备份，密码是女朋友Mary的生日。经过深思，刘建明决定做一个好人，请求陈永仁给他一次机会，陈永仁没有信，拷上了刘建明。最后陈永仁死在了韩琛的另一个警方卧底枪下，刘建明也杀死了那个开枪的卧底。
2、香港版结局
刘建明步出电梯时，向事后赶到的警员出示警员证，重申自已的警察身份。结果，林国平被刘健明嫁祸成黑帮间谍，刘健明成功由黑变白。陈永仁的卧底身份文件被李心儿意外发现使陈恢复身份，下葬于浩园黄志诚警司的墓旁，事件落幕。刘健明、李心儿及警队众人出席陈永仁的葬礼致敬。最后的回想片段中，表达了刘由始至终希望能与陈对调身份，走上不同的人生道路。
扩展资料：
剧情简介——
1991年，香港黑帮三合会会员刘健明听从老大韩琛的吩咐，加入警察部队成为黑帮卧底，韩琛许诺刘健明会帮其在七年后晋升为见习督察。1992年，警察训练学校优秀学员陈永仁被上级要求深入到三合会做卧底，终极目标是成为韩琛身边的红人。2002年，两人都不负重望，也都身背重压，刘健明渐想成为一个真正的好人，陈永仁则盼着尽快回归警察身份。
重案组从陈永仁手中获悉一批毒品交易情报，锁紧目标人物韩琛，没料情报被刘健明泄出，双方行动均告失败。但此事将双方均有卧底的事实暴露，引发双方高层清除内鬼的决心。命运迥异又相似的刘健明和陈永仁开始在无间道的旅程中接受严峻考验。
《无间道》这部电影当年上映的时候确实拍摄了两个版本的结局，香港版和大陆版各不相同。
1、大陆版结局：
陈永仁被大B打死，刘德华走入电梯杀了大B。电梯门开，吴廷烨上前：“刘健明，你被怀疑是黑社会卧底，我们现在要拘捕你。”刘健明交给他警员证，被戴上手拷。
2、香港版结局：
刘德华在电梯里把林家栋干掉，走出电梯的时候，举手那种自己的证件说，我是警察，然后结局就是，刘德华继续做着警察。陈永仁的身份终于在死後被证实，在墓地举行庄严的仪式上。大家都为他而惋惜。
扩展资料：
片名《无间道》中“无间”的意思是指“无间地狱”。该片以《无间道》作为片名，寓意两个身份都本不该属于自己的人，他们几乎生活在一个类似无间地狱的环境里，做梦都怕别人拆穿自己的身份。进入无间地狱是没有轮回的，只有永远受苦，但片中的两位主角却在寻求轮回 。
《无间道》的创作灵感源于吴宇森执导的电影《变脸》。麦兆辉认为《变脸》中“交换面孔”的桥段在现实中是不可能发生的事情，于是麦兆辉提出可不可以讲一个故事，将两个角色交换过来，但是不需要手术，只是身份和内心的交换。
麦兆辉、庄文强在创作《无间道》剧本的时候一直在写作上相互沟通，麦兆辉写完了一个完整的剧本，寄给庄文强，庄文强把剧本改了一遍又写信送给麦兆辉修改 。
在麦兆辉的剧本构想里，最初只有警察到黑社会卧底的故事线条。后来刘伟强又在原始剧本的基础上加了很多的元素进去，并加入黑社会的人去警局做卧底的另一条线。在剧本的修改过程中，《无间道》的定位也随之改变，电影剧本最初是警匪斗智为重，后来黑帮或英雄片的元素变得浓烈了。
参考资料来源：百度百科——无间道
本回答被网友采纳“2006年柏林电影节我去了，那时有记者问到一个问题。大家会记得《无间道》第一集的结尾刘德华被抓了，但香港的版本刘德华没有被抓就走了。记者问是不是国内审查要你们这样做，我说没有。我们拍到结尾时，我和刘伟强说还要拍另外的版本，香港的版本是刘德华逃了。但我们要拍另外的版本，我说另外的版本是给马来西亚的，因为在马来西亚，坏人是不能走的，一定要抓。他说放心吧，我在你没有来的时候已经拍了。有经验的制作人都知道那时的情况。
到现在马来西亚也是港片很重要的地区，那不是（内地）电影局让我们这样做的。到大陆来时，我们认为应该把这个版本放在里面比较好，也是考虑观众的想法。完全跟电影局的控制没有关系。
所以在大陆看到的是马拉西亚审查版……
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