一、郑州大学和云南大学各有所长，要看具体专业。综合实力，是郑州大学稍强。
二、郑州大学重点学科和优势专业
1、国家重点学科（2个，二级学科）：
凝聚态物理、
材料加工工程
2、国家重点（培育）学科（4个，二级学科）：
中国古代史、
有机化学、
化学工艺、
病理学与病理生理学
3、河南省一级重点学科：
应用经济学
法学
马克思主义理论
体育学
中国语言文学
外国语言文学
新闻传播学
考古学
中国史
世界史
数学
物理学
化学
生物学
生态学
统计学
力学
机械工程
光学工程
材料科学与工程
动力工程及工程热物理
电气工程
电子科学与技术
信息与通信工程
控制科学与工程
计算机科学与技术
建筑学
土木工程
水利工程
化学工程与技术
交通运输工程
核科学与技术
环境科学与工程
城乡规划学
软件工程
安全科学与工程
基础医学
临床医学
口腔医学
公共卫生与预防医学
药学
护理学
管理科学与工程
公共管理学
图书情报与档案管理
音乐与舞蹈学
4、河南省二级重点学科：
基础心理学
地图制图学与地理信息工程
皮革化学与工程
作物遗传育种
5、国家特色专业（14个）：
物理学、
化学、
预防医学、
工程力学、
水利工程、
化学工程与工艺、
材料科学工程、
通信工程、
新闻学、
法学、
历史学、
行政管理、
旅游管理、
金融学
三、云南大学优势专业和重点学科
1、国家级重点学科
民族学、生态学、专门史、微生物学。
2、省级重点学科
生态学、民族学、中国民族史、概率论与数理统计、中国经济史、工商管理、植物学、国际经济与贸易、基础数学、材料物理与化学、信息科学与技术、国际关系、民族法学、有机化学、思想政治教育、遗传学、旅游管理、人口资源与环境经济学、微生物学、化学、专门史、理论经济学、信息与通信工程、环境科学与工程、文艺学、公共管理、理论物理、气象学、系统分析与集成、生物学、金融数学、产业经济学、行政管理、物理化学、民族文化学、政治学、金融学。
3、校级重点学科
金融数学、产业经济学、行政管理、物理化学、民族文化学、政治学、金融学。
4、国家级特色专业
环境科学、化学、公共事业管理、计算机科学与技术、汉语言文学、国际经济与贸易、政治学与行政学、大气科学、生态学、新闻学、网络工程、旅游管理。
5、省级特色专业
电子信息科学与技术、经济学、数理基础科学、信息安全、英语、民族学、金融学、材料物理、行政管理、法学、制药工程。
综合实力郑州大学稍强，下面从多角度进行二者的分析对比：
一、师资力量
1、郑州大学：学校有教职工5800余人，其中两院院士、学部委员17人，海外院士4人；“国家杰出青年科学基金”获得者7人、“长江学者奖励计划”入选者11人、国家“百千万人才工程”人选24人。
2、云南大学：学校教职员工3023人，其中专业技术岗位2582人。专业技术岗位中教学科研人员2017人，具有正高职称的507人，具有副高职称的675人。
二、院系专业
1、郑州大学：郑州大学校本部设有51个院系，117个本科专业。
2、云南大学：学校下设26个学院、10个研究机构、2个独立学院，1个附属医院，设有研究生院，有本科专业79个，涵盖文、史、哲、经、管、法、理、工、农、教育、艺术11大学科门类。
三、学科建设
1、郑州大学：郑州大学有“双一流”建设学科3个，国家重点学科2个，国家重点（培育）学科4个，有30个一级学科博士学位授权点、3个博士专业学位授权点。
2、云南大学：学校有国家特色专业12个，29个专业入选国家级一流本科专业建设点，25个专业入选省级一流本科专业建设点。
以上内容参考 百度百科——云南大学
以上内容参考 百度百科——郑州大学