往来港澳签注分为6个种类：探亲（T）、商务（S）、团队旅游（L）、个人旅游（G）、其他（Q）和逗留（D）。根据申请事由分类签发。
1、探亲签注。（1）探望配偶，父母或者配偶的父母，子女，可以签发3个月一次签注，在香港或者澳门逗留不超过14天；或者3个月多次签注，在香港或者澳门逗留不超过自首次进入之日起90天。（2）探望兄弟姐妹，签发3个月一次签注，在香港或者澳门逗留不超过14天。
2、商务签注。（1）已办理登记备案的单位人员，根据各地制定的审批条件，可以签发3个月一次签注、3个月多次签注、1年多次签注，每次在香港或者澳门逗留不超过7天。（2）未办理登记备案的单位人员，个体工商户经营者，签发3个月一次签注，在香港或者澳门逗留不超过7天。（3）驾驶往返内地与香港或者澳门交通工具人员，可以签发3个月多次签注、1年多次签注，每次在香港或者澳门逗留不超过7天。
3、团队旅游签注。可以签发3个月一次签注、3个月二次签注、1年一次签注、1年二次签注，每次在香港或者澳门逗留不超过7天。
4、个人旅游签注。可以签发3个月一次签注、3个月二次签注、1年一次签注、1年二次签注，每次在香港或者澳门逗留不超过7天。
5、其他签注。可以签发3个月一次签注、3个月二次签注、1年一次签注、1年二次签注，每次在香港或者澳门逗留不超过14天。
6、逗留签注。签发多次签注，出境有效期根据香港或者澳门有关部门批准的期限签发。（1）赴香港就学、就业、培训人员及其亲属，签注出境有效期按照香港入境事务处进入许可批准的最长有效期签发。（2）赴澳门就学，签注出境有效期按照澳门高等教育辅助办公室出具的《确认录取证明书》批准的学习期限签发，但最长不超过1年。赴澳门就业，签注出境有效期按照澳门治安警察局出入境事务厅或者澳门社会文化司或者人力资源办公室批准的期限签发，但最长不超过2年。赴澳门就业人员的亲属，签注出境有效期按照澳门治安警察局出入境事务厅批准的期限签发，但最长不超过2年。持证人每次在澳门逗留不超过90天。
申请条件：
1、探亲。探望在香港或者澳门定居、就学或者就业的亲属。“亲属”是指：配偶，父母或者配偶的父母，子女，兄弟姐妹。申请人的配偶、子女可随同申请。
2、商务。（1）受单位派遣赴香港或者澳门商务。“单位”是指：经国家工商管理部门登记注册，具有独立法人资格的企业及其分支机构，或者在国家税务部门办理了税务登记且有生产经营的单位以及境外企业常驻内地代表机构。申请3个月或者1年多次商务签注，所在单位须事先向所在地公安机关出入境管理部门登记备案。（2）个体工商户经营者赴香港或者澳门商务。（3）驾驶往返内地与香港或者澳门专用交通工具人员。
3、团队旅游。参加国家旅游局指定旅行社组织的团队赴香港或者澳门旅游。
4、个人旅游。经批准开办常住居民个人赴香港或者澳门旅游。
5、其他。（1）因治病、奔丧、诉讼、应试、处理产业、学术交流等特殊事由申请赴香港或者澳门。（2）在澳门就学、就业的内地居民申请赴香港。
6、逗留。经香港或者澳门有关部门批准在香港或者澳门就学、就业、培训的人员及其亲属。
新办
首次办理须本人至户籍所在地的出入境管理处提交申请，申请材料有：居民身份证和户口簿的原件及复印件（用A4纸复印，可复印在同一张纸上）以及填写《中国公民出入境证件申请表》，2寸淡底色彩照2张（也可现场拍照，费用自付），同时分别申请赴香港、澳门的签注。只去香港则申请香港签注，只去澳门则申请澳门签注，如果香港、澳门都去，则两地签注都要申请。
【办理时限】自受理之日起10个工作日（首次或非首次申请）。但均不含邮递日（一般在五天左右）以及节假日。
【费用】《往来港澳通行证》每本100元；一次往来签注，每个20元，二次往来签注，每个40元，并外加签注加注费20元。