经过多年的努力，我国科技体制改革取得了重要进展和初步成效，主要体现在以下五个方面：第一，优化了科技力量结构和布局。 改革前，我国的研发能力和技术资源主要集中在独立的研究机构， 经过多年改革，形成了科研院所、高校、企业和科技中介机构等各具优势和特色的创新模式。企业在技术创新中的主导地位继续加强，2007年企业研发经费支出占全国的72.3%，企业研发人员占全国的68.4%。 第二，促进了科技与经济的紧密结合。 通过对开发类院所实施企业化转制，从体制上解决了大批应用开发类院所长期游离于企业之外的问题，科技人员市场意识和技术创新能力显著增强。近年来，我国在载人航天工程、“歼10”飞机、超级计算机、核心软件、集成电路装备、大型燃气轮机、超级稻育种技术、新药创制等领域取得重大突破，为社会经济发展提供了强大支撑。 第三，加强了公益性科技创新和服务能力。配合推进公益类科研院所分类改革，国家持续加大对公益科研的投入，非营利性科研机构的人均事业费从过去的不足2 万元，提高到目前的8 万元左右，2007 年国家新增“ 基本科研业务费”、“ 修缮购置专项经费”、“ 研究生培养补助经费”、“ 增拨离退休人员费” 合计19 亿元。改革后公益科研院所的学科结构得到优化，人员水平明显提升，实行了新型的人事和分配等制度，科研人员任务饱满， 科技产出大幅增加，解决农业和社会发展的若干具有重大科学和技术领域的问题，促进了先进适用技术，为农业和社会福利服务的发展提供了有力的支撑和服务。 第四，我国科技水平和实力大幅提升。 我国科技论文被国际三大检索系统收录的总数已居世界前列，特别是SCI 收录的中国科学家论文数已居美国之后， 与英、德、日三国相当，数学、物质科学、生命科学和工程科学等领域论文增长明显，纳米领域的论文数量已居世界前两位，引用数也进入世界前列。2008 年我国专利申请量达到82.8 万件， 发明专利的申请量达到29 万件，占世界第三位。科学家和技术人员队伍建设不断加强，2008 年从事科技活动人员达500 万人，研发人员190 万人，位居世界前列。 第五，改进了科技管理和运行机制。 通过改革，改变了主要依靠行政手段管理科技工作的局面，市场机制在科技资源配置中扮演一个根本角色，政府科技计划项目实施的竞争资助机制不断改进和完善。 科技政策法规体系逐步完善， 新修订了《科技进步法》，围绕实施《规划纲要》，制订公布了76 条政策实施细则。促进创立“开放、流动、竞争、协作”的科研新机制，激发了科技人员的创新热情。
