怎样在PrimerBank中查找小鼠β-actin引物?

Question

如题所述

Answer 1

话说我经常用这个，因为实在是很方便呀，很多RT-RCR或Q-PCR的引物都是别人用过的，这个是Harvard University的，网址如下

pga.mgh.harvard.edu/primerbank/

首先，先去NCBI搜索到beta actin的gene ID，因为如果直接在primerbank中search的话，会有很多不相关的基因出来

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/11461

然后在，primerbank中，search

得到结果为：

Gene Descriptions:    

NCBI GeneID    11461    

GenBank Accession    NM_007393    

NCBI Protein Accession    NP_031419    

Species    Mouse    

Coding DNA Length    1128    

Gene Description    Mus musculus actin, beta (Actb), mRNA.    

Primer Pair 1 (Click here for cDNA and amplicon sequence):    

PrimerBank ID    145966868c1    

Amplicon Size    245    

Sequence (5' -> 3')    Length    Tm    Location    

Forward Primer    GTGACGTTGACATCCGTAAAGA    22    60.3    854-875    

Reverse Primer    GCCGGACTCATCGTACTCC    19    61.6    1098-1080    

Primer Pair 2 (Click here for cDNA and amplicon sequence):    

Validation Results  (Click here to view experimental validation data: amplification plots, dissociation curves, 2% agarose gel analysis, sequencing and BLAST data)    

PrimerBank ID    6671509a1    

Amplicon Size    154    

Sequence (5' -> 3')    Length    Tm    Location    

Forward Primer    GGCTGTATTCCCCTCCATCG    20    61.8    84-103    

Reverse Primer    CCAGTTGGTAACAATGCCATGT    22    61.1    237-216    

Answer 2

去google scholar上搜 mouse β-actin primer sequence 看人家用的啥直接用就行了 当然了得先去blast一下确定人家不是故意贴个错的序列 虽然一般不会。。。