L为了抓住月把自己的名字写上了死亡笔记啊，在三天后抓住了月，但是自己却还只剩下20天的生命。在和月的战斗中，渡不幸去世了。L在最后的20天里都在处理案件。而其中的主要事件就是L卷入到了一个关于一种新型病毒的传播事件中。
有一个组织企图在全世界范围内传播一种病毒。这个病毒是由亚洲传染病中心的一个博士研发的。她的真是身份是K，而且也受过渡的照顾，知道渡的死也很难过。k研究这种病毒后，在泰国开始了传播，但是由于病毒变异过快，没有研究出抗病毒制剂，导致泰国某小镇的居民全灭。在这个小镇中有一个被派去调查的FBI成员救出了一个没有被感染的小男孩。FBI为了救这个boy也死了，本来这个男孩是交给渡的，但是渡死了，所以由L接收了。L说这是给渡的礼物。所以L开始带小孩。
另一方面k所在的研究所的博士发现了这种病毒，并制作出了抗病毒制剂。可是博士发现了这个阴谋，为防止病毒的传播就毁灭了资料还自杀了。最后让自己的女儿带着病毒去找渡。女孩在回去拿自己的布娃娃的时候目睹了自己父亲自杀的惨剧。在k追捕她的时候给自己注射了病毒。当然还是L接手这个。于是L就这么带这两个小孩子去找博士的朋友发明抗病毒制剂。其中也不乏温馨场面，L可能是感受到了亲情，在处理完劫机和送那个男孩去孤儿院后。突然说想在世界上多活几天。
那个天才男孩L给他起名为near，在动画版里是L的继承人...在劫机事件中L还救了被病毒感染的K，告诉她要好好活下去。
平凡的大学生夜神月（洼田正孝饰）跟在警视厅搜查一课上班的夜神父亲总一郎以及妹妹妆裕共同生活。某天，他捡到死神遗落在人间的笔记本，名字被写在这个本子上的人就会死去。开始，夜神月只是当成玩笑，把威胁好友鸭田的佐古田的名字写了上去，但是佐古田死掉了。佐古田的死让很多人感到高兴，而月也产生了一种奇妙的感觉。之后，月使用笔记的力量不断杀死罪犯，并引起了国际刑警组织的注意，国际刑警组织邀请华尔米兹之家的侦探L（山崎贤人饰）来到日本，同夜神总一郎等人共同展开调查。从此，夜神月与L展开了生死对决。
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