法律分析：民事诉讼不会留下案底，案底是犯罪人的犯罪记录，是会记录到个人档案中的，刑事诉讼中定罪的人才会有案底。民事纠纷，由法院负责管辖并裁决，法院会对民事纠纷案件存档。所以，民事纠纷案件，法院当然会有案件记录(案底)。但这里的案底只是法院的案件档案，不是行政处罚案底，也不是刑事犯罪案底。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》 第一百二十三条 人民法院应当保障当事人依照法律规定享有的起诉权利。对符合本法第一百一十九条的起诉，必须受理。符合起诉条件的，应当在七日内立案，并通知当事人；不符合起诉条件的，应当在七日内作出裁定书，不予受理；原告对裁定不服的，可以提起上诉。