阴囊皮肤本身的病变，如皮肤感染、蜂窝组织炎或者毛囊炎等，都可以出现阴囊皮肤的疼痛，外观上皮肤发红，并且局部有脓性分泌物或者包块等，触摸时疼痛明显。阴囊内附属器官的疼痛，如睾丸炎或者附睾炎。炎症出现时，阴囊可出现肿大，睾丸、附睾肿大并且伴有明显的疼痛，皮肤外观上可发红，但一般皮肤不存在溃烂和包块，用手触摸时，阴囊内的睾丸或者附睾肿大明显。其他部位疼痛的放射疼痛，如输尿管下段结石出现下腹部的疼痛，放射至阴囊，外观看阴囊皮肤未发红，没有溃烂，皮肤完整，并且阴囊内睾丸、附睾脏器未发生肿大。建议行泌尿系B超，排除是否存在输尿管末端的结石，而导致阴囊放射性疼痛。
阴囊疼痛最大的可能性就是急性睾丸炎、附睾炎。它最主要的表现就是阴囊明显肿胀，阴囊皮肤发红、发热、疼痛，并且沿精索、下腹部以及会阴部会有放射。对于阴囊疼痛一定要做阴囊彩超检查，有效的确诊到底是附睾炎、睾丸炎，还是睾丸扭转。睾丸扭转是急诊手术，需要紧急处理。而阴囊导致的附睾睾丸炎是一种慢性炎症的表现，需要消炎治疗，卧床休息为主。
阴囊皮肤的蜂窝组织炎，如此部位发生蜂窝织炎可以出现局部红肿，伴有明显疼痛感，可见局部肿胀、皮温升高或者伴有局部破溃、渗出等改变。阴囊内容物出现相关病变，如睾丸炎或者附睾炎可以造成阴囊放射性疼痛，活动后加重，休息后减轻。同时可伴有阴囊皮肤红肿或者阴囊体积增大等改变，需要进一步行B超检查，确诊阴囊内容物有无相关病变。
睾丸恶性肿瘤可以出现阴囊皮肤放射疼痛，肿瘤有时破溃而引起阴囊皮肤粘连，造成皮肤有肿瘤灶，可以引起较严重的疼痛感。外观检查可见局部皮肤破溃或者伴有硬结、溃疡等改变。输尿管末端结石有时可引起肾绞痛，同时疼痛可以放射至阴茎、阴囊等部位，伴有尿频、尿急、排尿疼痛的症状。建议进行泌尿系统B超检查，排除有无输尿管末端结石存在。