用企业网银代发工资是不收取手续费的。一般来说，如果使用的是某银行代发工资，员工的银行卡也会是统一银的，代发工资实际上就是一种转账行为(同行、同城)，所以是不需要收取手续费的。
如果员工的工资卡是他行或者是外地的话，会根据转账金额的大小和转账的性质收取一定的手续费用的。代发业务需先与银行签订纸质协议，协议上会规定具体的收费，可联系
开户行查询，不同银行规定不尽相同。拓展资料：代发工资，是专业机构为机关
企事业单位、公司员工代发劳动报酬等款项的一项金融
中间业务。
专业机构通过自身联网的核心业务处理系统进行批量、集中支付，将有关工资等款项自动转入储户预先约定的银行卡或个人结算账户上，代理企、事业单位发放工资，还可代理
社会保险局发放
社会福利保险金等。代发工资的有点很明星，银行代发，省时省力。集中支付，安全快捷。经有代发工资需求的单位提出申请并与金融机构协商后，由代发工资单位填写代发工资委托协议书给金融机构，金融机构根据申请单位要求向其员工集中、批量发放工资。金融机构通过自身联网的核心业务处理系统进行批量、集中支付，将有关工资等款项自动转入储户预先约定的银行卡或个人结算账户上，代理企、事业单位发放工资，还可代理社会保险局发放社会福利保险金等。
如果一个企业选择某一个银行作为工资代发，一般这个企业跟银行之间的合作关系都比较密切，平时这个企业的对公业务往来也有可能通过这个银行走账，而企业的资金大多时候都是活期，对银行来说
活期存款的成本是最低的。意味着一旦某个企业选择一家银行作为代发工资之后，这个企业就可以给这家银行带来很多活期存款，这不仅可以帮助银行完成存款任务考核，还可以给银行带来很可观的收益。当然除了存款之外，银行还有可能跟这家企业有贷款之间的来往。而通过为企业代发工资，银行可以最直观地了解这家企业的实力，企业的
现金流，企业的资产等等，这样可以让银行的贷款更加安全。
【拓展资料】
《中华人民共和国个人所得税法实施条例》第二十七条 纳税人办理纳税申报的地点以及其他有关事项的具体办法，由国务院税务主管部门制定。
第二十八条 居民个人取得工资、薪金所得时，可以向扣缴义务人提供专项附加扣除有关信息，由扣缴义务人扣缴税款时减除专项附加扣除。纳税人同时从两处以上取得工资、薪金所得，并由扣缴义务人减除专项附加扣除的，对同一专项附加扣除项目，在一个纳税年度内只能选择从一处取得的所得中减除。
居民个人取得
劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，应当在汇算清缴时向税务机关提供有关信息，减除专项附加扣除。