主要区别是，科目分类不同、形态特征不同、生长习性不同，具体如下：
一、科目分类不同
1、红毛丹
红毛丹，别名毛荔枝，韶子，红毛果，红毛胆。属无患子目、无患子科、韶子属、红毛丹种。
2、荔枝
荔枝，别名离枝。属无患子目、无患子科、荔枝属、荔枝种。
二、形态特征不同
1、红毛丹
小枝圆柱形，有皱纹，灰褐色，叶轴稍粗壮，干时有皱纹，薄革质，椭圆形或倒卵形，花序常多分枝，与叶近等长或更长，被锈色短绒毛；花梗短；萼革质，果阔椭圆形，红黄色。花期夏初，果期秋初。
2、荔枝
小枝圆柱状，褐红色，密生白色皮孔。叶连柄长10-25厘米或过之，薄革质或革质，披针形或卵状披针形，有时长椭圆状披针形，背面粉绿色，两面无毛，花序顶生，阔大，多分枝；花梗纤细，有时粗而短；萼被金黄色短绒毛，果卵圆形至近球形，成熟时通常暗红色至鲜红色；种子全部被肉质假种皮包裹。花期春季，果期夏季。
三、生长习性不同
1、红毛丹
喜欢高温多湿，没有风害，低海拔的山地环境。年平均温度在24摄氏度以上，最冷月的温度要高于17摄氏度适合红毛丹的生长发育。红毛丹幼苗期不耐旱，需要适当增加水分管理。果实生育期最需要水。土壤以土层深厚，富含有机质、肥沃疏松、排水和通气良好为好。喜生长在热带地区。
2、荔枝
喜高温高湿，喜光向阳，它的遗传性要求花芽分化期有相对低温，但最低气温在-2至-4℃又会遭受冻害；开花期天气晴朗温暖而不干热最有利，湿度过低，阴雨连绵，天气干热或强劲北风均不利开花授粉。花果期遇到不利的灾害天气，会造成落花落果，甚至失收。
1、外表不同
红毛丹的果壳上有很多红毛，所以才称之为红毛丹，享有热带果王的名誉。
荔枝的果皮呈鳞斑状凸起，颜色为鲜红或是紫红色。肉质为半透明的凝脂状。
2、吃法不同
红毛丹与荔枝个剥开后都能直接看到果肉，但是红毛丹在它的果核外面是有一层比较硬的保护膜的，这层膜不可以食用，而荔枝就不需要注意这一点，可以大口的吃。
3、口感不同
两者相比，荔枝要甜一些，而红毛丹味道要淡一点。
4、产地不同
红毛丹的原产地在马来西亚，越南以及泰国等地，现在在我国海南有种植。
荔枝产自于中国的南部地区，是一种亚热带的果树，一般高在10米左右，是一种常绿的乔木。
本回答被网友采纳1、外形不同。切记，这不是变种的荔枝……在红毛丹的外面是毛茸茸的软毛刺，而荔枝表面，顶多有一些刺手的疙瘩。
2、壳的硬度不同。红毛丹的外壳要比荔枝的外壳要硬，所以人们在剥开红毛丹的时候，要注意不要割伤手了。
3、吃法不同。虽然两者都是直接剥开就能看到果肉，不过红毛丹的果核外面有层保护膜是不能吃的，而荔枝就能干脆地要下一大片果肉，不用担心有果核膜。
4、价格的不同。红毛丹毕竟在东南亚是热卖的水果，在中国本土还是比较少地方能生产，如果从外国进口的话，价格就会昂贵，一般在30-45元/斤左右，而荔枝作为岭南四大名果之一，在我国南部有很多产地，价格为8-20块/斤，鉴于产地不同、品种不同、时节因素等，也会有价格的较大浮动。
吃红毛丹的注意事项
1、红毛丹要即买即食，不宜久藏，在常温下经3天即变色生斑。若量多过剩时，可密封于塑胶袋中，放冰箱冷藏，约可保鲜l0天左右。
2、红毛丹的果壳较荔枝厚，用指甲剥会伤害手指，而且也不卫生，正确的方法是用两只手上下握住，像开瓶盖一样将它旋开。
3、红毛丹属温性水果，多吃容易生热上火，故平常有口干舌燥、扁桃腺发炎、脸长青春痘、高血压压、牙周病、口臭强烈、便秘、痔疮、热咳等热性病者不宜多吃。
4、红毛丹的果核上有一层坚硬且脆的保护膜，和果肉紧密相连。这层膜人的肠胃是无法消化的，吃到肚子里会划破肠胃内壁，食用时一定要将这层膜剔除干净。
1、外形不同。切记，这不是变种的荔枝……在红毛丹的外面是毛茸茸的软毛刺，而荔枝表面，顶多有一些刺手的疙瘩。
2、壳的硬度不同。红毛丹的外壳要比荔枝的外壳要硬，所以人们在剥开红毛丹的时候，要注意不要割伤手了。
3、吃法不同。虽然两者都是直接剥开就能看到果肉，不过红毛丹的果核外面有层保护膜是不能吃的，而荔枝就能干脆地要下一大片果肉，不用担心有果核膜。
4、价格的不同。红毛丹毕竟在东南亚是热卖的水果，在中国本土还是比较少地方能生产，如果从外国进口的话，价格就会昂贵，一般在30-45元/斤左右，而荔枝作为岭南四大名果之一，在我国南部有很多产地，价格为8-20块/斤，鉴于产地不同、品种不同、时节因素等，也会有价格的较大浮动。
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