此合作涉及什么税收问题吗？
涉及流转税（营业税）与所得税。
1）收入款项转入A 公司
A公司交营业税（没有营改增的话），税率5%，以及附加税（城建税等，营业税的12%）
2）剩余两公司平分
A公司交利润的25%所得税。
3）两公司分红时，如果双方都是公司，不用纳税；如果是个人，还要交个人所得税，税率20%。
B公司提取此款项时A怎样处理呢？
就按分红处理
借：利润分配—应付股利（或应付利润）
贷：银行存款 / 库存现金 （如果只做账，而没有实际支付，贷方：应付股利）
追问A与B的合作只是A公司一部分业务，不是全部收入。也是按分红处理？
追答可以按本次业务所获利润分红，前提是能与公司其他业务合理拆分。