在中国。
国防部是国务院的军事工作部门。它的基本职能是：统一管理全国武装力量的建设工作，如人民武装力量的征集、编制、装备、训练、军事科研以及军人衔级、薪给等。国防部的工作由解放军总部机关分别办理。
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总参谋部是中央军事委员会的军事工作机关，是全国武装力量军事工作的领导机关，在中央军委领导下负责组织领导全国武装力量的军事建设和组织指挥全国武装力量的军事行动
国务院和中央军委是平行的，各自下属的国防部和总参谋部也是平行的。
两者的主官都必定是军委委员，国防部长一般是由比总参谋长更资深的军委委员来坦任，国防部的地位也比总参谋部略高，但并不说明国防部比总参谋部有实权，因为，说白了国防部其实是这么一个单位——传中央军委的话、用国务院的名义、让指定的相关部门去做与军方有关的事。
诚然，现任国防部长梁光烈当然要比现任总参谋长陈炳德有权力，这不是因为国防部比总参谋部牛，而是因为在中央军委委员的排名中，梁光烈更靠前，是中央军委里分管作战与指挥的军委委员，同时还是国务委员（所谓的“国务委员”就是比国务院副总理稍低但绝对比各部部长高的那么一个职务，嘿嘿）。
在西方国家，比如美国则是另一种情况了，他们的国防部长肯定是文官（中国是武官），国防部长的职权肯定比任何一名在职军人都高。
参考资料：bbs.tiexue.net/post2_2935648_1.html 114K 2008-7-27