（一）体训一大队
承担田径、速度滑冰、篮球、排球、沙滩排球、乒乓球、女子手球等运动队的训练和竞赛工作。
（二）体训二大队
承担射击、射箭、马术、自行车、航空模型、摩托车等运动队的训练和竞赛工作。
（三）摔跤柔道运动管理中心
承担古典式摔跤、自由式摔跤、柔道、举重、武术散打等运动队的训练和竞赛工作；承担全区相关运动项目的发展和推广普及工作。
（四）足球运动管理中心
承担本中心足球运动队的训练和竞赛工作；承担全区足球运动项目的发展和推广普及工作。
（五）拳击运动管理中心
承担本中心拳击运动队的训练和竞赛工作；承担全区拳击运动项目的发展和推广普及工作。
（六）登山运动管理中心
按照国家、自治区有关规定，经自治区人民政府、新疆军区批准和自治区体育局授权，具体承担自治区境内登山运动管理和服务工作；开展体育旅游业务工作。
（七）新疆竞技体育运动学校
承担具有中等教育程度体育后备人才的培养任务；承担全区体育系统工作人员在职继续教育工作。
（八）体育科研
面向体育运动训练实际，研究运动营养、康复等课题；
（九）健身气功管理中心
组织拟定自治区健身气功发展规划和规章制度，监督管理全区健身气功活动；
（十）新疆体育编辑部
编辑、出版《新疆体育》杂志。
（十一）新疆体育中心
承办各类体育竞赛活动和大型群众性文化体育活动；开展运动项目的技术培训、咨询等工作；承担中心所属体育场馆及其他体育设施的经营、管理和维护工作。
（十二）体育彩票管理中心
承担新疆维吾尔自治区体育彩票发行、管理等工作。
（十三）体育器材装备中心
按照有关规定，承担自治区体育系统所需体育用品的采购、供应等工作。
（十四）机关服务中心
承担局机关的后勤服务等工作。
（十五）国际武术培训中心
（十六）体育总会秘书处
（十七）老年人体育协会
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