特许经营许可证申请流程和办理的方法：
商业特许经营，是指拥有注册商标、企业标志、专利、专有技术等经营资源的企业（以下称特许人），以合同形式将其拥有的经营资源许可其他经营者（以下称被特许人）使用，被特许人按照合同约定在统一的经营模式下开展经营，并向特许人支付特许经营费用的经营活动。企业以外的其他单位和个人不得作为特许人从事特许经营活动。
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一、服务对象从事特许经营活动应当拥有至少2个直营店，并且经营时间超过1年。特许人应当自首次订立特许经营合同之日起15日内，向商务主管部门备案。各地商务主管部门、企业、社会公众
二、法律依据《商业特许经营管理条例》《商业特许经营备案管理办法》
三、申请条件
企业以外的其他单位和个人不得作为特许人从事特许经营活动。拥有注册商标、企业标志、专利、专有技术等经营资源的企业。从事特许经营活动应当拥有成熟的经营模式，并具备为被特许人持续提供经营指导、技术支持和业务培训等服务的能力。
申请材料特许人向商务主管部门备案，应当提交下列文件、资料：
（一）商业特许经营基本情况。
（二）中国境内全部被特许人的店铺分布情况。
（三）特许人的市场计划书。
（四）企业法人营业执照或其他主体资格证明。
（五）与特许经营活动相关的商标权、专利权及其他经营资源的注册证书。
（六）符合《条例》第七条第二款规定的证明文件。
在2007年5月1日前已经从事特许经营活动的特许人在提交申请商业特许经营备案材料时不适用于上款的规定。
（七）与中国境内的被特许人订立的第一份特许经营合同。
（八）特许经营合同样本。
（九）特许经营操作手册的目录（须注明每一章节的页数和手册的总页数，对于在特许系统内部网络上提供此类手册的，须提供估计的打印页数）。
（十）国家法律法规规定经批准方可开展特许经营的产品和服务，需提交相关主管部门的批准文件。
（十一）经法定代表人签字盖章的特许人承诺。
（十二）备案机关认为应当提交的其他资料。
直营店是指由特许人拥有的店铺包括全资拥有和控股拥有，且直营店与特许人应属同一品牌、同一业务性质。在实践中表现为分公司、子公司（控股）、店中店等多种形式。
商务部特许经营备案的条件，办理特许经营备案费用及流程，部门办理时间一次性告知函连锁加盟申请指南
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商业特许经营备案
2015年以前，商业特许加盟许可证(特许经营备案)没有纸质的公式方式，需通过网上申报及公示，由商务部部门具体负责。由于，这种方式在目前的互联网环境真伪难辨，2015年商务部最终决定通过了商业特许经营备案认证的企业均由商务部出具认证铜牌和认证证书，并且2015年3月9日前已经申请特许加盟认证的可以向商务部申请补充追认。
办理特许经营备案的规定和要求如下：
一、办理需要的基础条件
1. 首先要取得商业特许经营备案资质，只有取得商业特许经营备案的企业可以作为特许人从事特许经营活动，其他单位和个人不得作为特许人从事特许经营活动。
2. 从事特许经营活动的商业特许经营备案企业应当拥有成熟的经营模式，并具备为被特许人持续提供经营指导、技术支持和业务培训等服务的能力。
3. 商业特许经营备案特许人从事特许经营活动应当拥有至少2个直营店，并且经营时间超过1年。这项条件，通常被称为“两点一年” ，目的是为了防止一些企业利用特许经营进行的欺诈。
二、应该什么时候去办理
根据《商业特许经营管理条例》的规定。特许人须在自第一次订立特许加盟合同之日起15日内，依照相关条例向商务主管部门申请备案。在省级行政单位范围内从事特许加盟活动的，应当向当地的省级人民政府商务主管部门申请备案;跨省从事特许加盟活动的，需要直接向商务主管部门(商务部)申请备案。如不申请备案，面临的商务主管部门的行政处罚。所以商业特许经营备案属于法律强制性规定，如果不进行备案就进行特许经营活动，被查到会面临法律后果。
三、需要准备哪些材料
据法律规定，特许经营备案应当向商务部门提交以下材料：
(1)特许加盟企业的基本经营情况。
(2)中国境内全部加盟商的店铺分布情况说明。
(3)市场计划书。
(4)加盟主体资格证明文件及复印件，如企业营业执照复印件。
(5)特许加盟相关的商标、专利和其它形式的经营资源的注册证书复印件。
(6)市级(地级市)单位商务部门开具的证明文件;直接经营的店铺设立在国外的，特许人需要交直营店铺营业证明(中文翻译件)，还需要当地公证机构进行公证加上中国驻当地使领馆的认证。
(7)特许加盟合同。
(8)特许经营手册目录。
(9)如果根据法律规定需要国家批准才能办特许加盟(这就类似于前述的特许加盟许可证)的行业，须提交相关主管部门的批文。
(10)申请特许加盟人的书面承诺(需要法定代表人签字盖章)。
四、办理程序和通过备案
(1)特许人向市商务局申请备案并提交材料（1－6项）以获取商务部商业特许经营管理号和密码；
(2)特许人获取登录号和密码后，登录商务部商业特许经营信息管理系统填报备案材料，并向市商务局提供纸质备案材料（7－15项）；
(3)市商务局按照备案管理办法要求对材料进行核实，对符合条件的企业予以备案。
至此特许经营许可备案通过。
按流程上面讲15个工作日，其实是远远不够的，当然，也有比这个还要早的，但是大家都知道政府的办事效率，特别是一些地区，所以要办的尽早办，我有个朋友，办这个证，花了3个多月时间，这个不能拖，你拖得越久对自己越不利，至于办理需要的硬件设施，好像必须有实体店面，有些地区应该会放宽条件，自己多咨询下当地部门。
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