为了减少或消除抗生素的使用，需要从以下三个方面来考虑：
（1）选择有抗菌、抑菌或杀菌活性的饲料添加剂饲料添加剂特别是抗生素替代品的合理选用，是替代抗生素的重要途径之一。例如产细菌素（微生物源抗菌肽）的有益微生物、功能性肽蛋白、酶制剂及寡糖类饲料添加剂，不仅具有改善畜禽肠道有益菌群、补充内源酶的不足、促进生长、提高免疫及抗菌抗病毒能力和提高饲料转化效率等方面的优点，而且无残留、不会产生耐药性，是抗生素的优秀替代品，联合使用上述产品，抗生素的替代效果会更好。
（2）对饲料原料进行更完善的加工处理（生物或物理加工）饲料配方的配制以及饲料原料的选择也是重要的考虑因素之一，为了减少或消除抗生素的使用，必须针对不同品种和生长阶段的畜禽配制营养均衡（能量蛋白平衡、氨基酸平衡等）且适口性好、易消化的饲料，并且在加工过程中要减少营养物质的流失等问题，来确保为畜禽提供充足的营养物质。另外，在饲料原料选择时，也可以优先选择如发酵豆粕、膨化玉米等经过一定手段处理过的易消化、易吸收的原料。
（3）改善饲养管理，创造更加清洁舒适的饲养环境由于饲养管理不善会使畜禽产生应激反应，因此，如何改善饲养管理也是如何替代抗生素的重要考虑方面。为了减少引起动物的应激，必须为其创造良好的饲养环境：设置适宜的温度；清洁空气（可以使用环境优化器，对空气进行过滤，或使用除臭剂，减少NH3和H2S等臭气的排放）；使用环境友好型消毒剂，降低环境中有害微生物的数量。
要解决抗生素所带来的一些问题，不是从某个单一方面就能完全替代掉抗生素，而是多方面综合治理的结果，需要从以上三个方面着手，才能更好地替代抗生素。
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