求助，r语言怎么画差异蛋白的火山图

Question

如题所述

Answer 1

火山图是一种用于显示统计学显著性与倍数变化之间关系的图形。在生物信息学中，火山图常用于展示基因或蛋白的表达差异。火山图的x轴代表对数变化（如对数2倍数变化），y轴代表统计学显著性的负对数值（如-log10的p值）。
下面是一个使用ggplot2绘制火山图的基本示例：
在这个示例代码中：
1.log2FC是对折变化（fold change）取log2的结果，用于展示每个蛋白质的表达变化程度；
2.adj.P.Val是调整后的P值，用于评估差异表达的统计显著性；
3.这两者的组合在火山图上表现为每个点的坐标；
4.通过标记显著差异表达的蛋白质，你可以快速识别在实验条件下调控的关键分子。
注意：实际的分析和绘图代码将取决于你的具体数据结构和研究问题。确保根据实际情况调整代码中的阈值和参数。

Answer 2

建议加载 Package scatterplot3D (画三维的) 或者 用 ggplot2 详情请去 统计之都 （ http:// cos.name) demo(graphics) #演示 只需按 ENTER就行，会给出代码的本回答被网友采纳