变频器只能手动运行而不能自动运行可能是由于以下原因：
控制信号问题：变频器的自动运行需要接收到来自外部控制系统的信号才能启动。如果控制信号传输存在问题，例如信号线路故障、信号传感器故障等，就无法实现自动运行。
参数设置问题：变频器的参数设置可能不正确，导致无法实现自动运行。例如，可能没有正确设置启动方式、运行模式、运行命令等参数。
故障检测问题：变频器内部可能存在故障，例如电路板故障、电源故障、驱动器故障等，导致无法自动运行。
缺乏外部设备支持：有些变频器需要与其他设备配合使用才能实现自动运行，例如传感器、PLC等。
如果缺乏这些外部设备支持，就无法实现自动运行。如果变频器只能手动运行而不能自动运行，可以按照以下步骤进行排除故障：
检查控制信号传输是否正常，例如检查信号线路是否接触良好，检查传感器是否工作正常等。
检查变频器的参数设置是否正确，例如检查启动方式、运行模式、运行命令等参数是否设置正确。
检查变频器是否存在故障，例如检查电路板是否损坏，检查电源是否正常供电，检查驱动器是否工作正常等。
确认是否需要外部设备支持，如果需要，检查这些外部设备是否正常工作。
如果以上排除故障的方法无法解决问题，建议联系专业的变频器维修人员进行检修。