秦始皇并没有留下后代。他在沙丘宫去世后，赵高和李斯密谋篡改遗诏，让胡亥继位。由于胡亥的帝位来得不正当，他担心兄弟们会篡夺权力，因此将所有兄弟姐妹杀害，随后赵高又灭了他的家族，导致秦始皇没有后代存活。因此，秦氏家族不可能是秦始皇的后裔，因为这一前提本身就不存在。
“秦”只是一个国号，并非国君的姓氏。秦国公室是嬴姓赵氏家族，包括秦始皇在内，所有君主都姓赵，而非姓秦。秦始皇的本名是赵政，这一点在许多经典正史中有确凿的记录。《史记》中记载：“太史公曰：秦之先为嬴姓，其后分封，以国为姓，有徐氏、郯氏、莒氏、终黎氏、运奄氏、菟裘氏、将梁氏、黄氏、江氏、修鱼氏、白冥氏、蜚廉氏、秦氏。然秦以其先造父封赵城,为赵氏。”清楚地表明：秦国王族姓赵。
秦氏的起源并不单一，大致有四个来源，其中只有一个与秦国有关，而这个来源也不是秦国公室本身，而是其后裔。1、中国正统的秦姓实际上源自山东鲁国的周公旦的后裔，这一支姬姓人士的食邑被封在秦邑（河南范县），他们便以秦为姓。2、秦朝灭亡后，皇室遗留下来的宗族中有一些人将自己的姓改为“秦”，即所谓的“以国为姓”，这就是与秦国有点渊源的那部分秦姓。这个秦姓出现的时候，秦国也好，秦朝也罢，都已经不存在了。3、汉晋时代，从罗马帝国来到中国的一些侨民，因为他们的祖国在中国的称呼是“大秦”，所以自称姓秦。4、夷戎蛮族汉化后，有一些人改姓秦。综上所述，今天的秦姓与秦始皇有直接联系的可能性基本为零，但可能是他同族的后代。
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