红豆杉母树更值钱。
解释：
1. 红豆杉母树稀有度高： 在自然环境下，红豆杉母树相较于公树生长更为困难，因此数量稀少。母树的生长周期更长，具有更高的存活率，使得其木材更加珍贵。
2. 木材质量更优： 红豆杉母树的材质纹理更细致，重量适中，不易变形。其含有的油脂较高，使木材散发出一种独特的香气，这也是母树木材倍受追捧的原因之一。
3. 药用价值高： 中医学上，红豆杉母树的部分部位具有一定的药用价值。母树的根部、树皮等部分在药材市场上也有较高的需求。因此，这也使得母树红豆杉的经济价值进一步提升。
综上所述，由于红豆杉母树的稀有性、优质的木材以及潜在的药用价值，使得母树红豆杉相较于公树更为值钱。