25个专科被卫生部中国医师协会批准为首批专科医师培训基地试点单位。妇科和耳鼻喉科被卫生部中国医师协会内镜医师分会批准为内镜诊疗技术培训基地。心血管内科被卫生部中华医学会批准为心律失常介入诊疗技术培训基地。设有全国心脑血管病防治领导组、省立体定向神经外科研究所、安徽省老年病研究所、安徽省循证医学中心、安徽心脏中心、省心血管病研究所、省临床检验中心、省防盲技术指导中心、省放免中心、省儿麻矫治中心、省白内障复明中心、省血友病管理中心、省器官移植中心、省听力康复研究中心、省麻醉质量控制中心、安徽省护理质量控制中心以及院肝胆病、血液病、糖尿病研究室，中心实验室等，下设安徽省肿瘤医院和安徽心脑血管医院各一所。医院拥有33个硕士点和博士生联合培养点，是安徽医科大学附属省立医院。
医院备有PET/CT、3.0T MR、高压氧仓中心、适形调强治疗系统、16排螺旋CT扫描仪、CR系统（计算机X光机摄影）、ECT、DSA、直线加速器、彩色心脏多普勒诊断仪、大型自动生化分析仪、电子显微镜、流式细胞仪等大型先进设备。全院现有仪器设备固定资产总值超过2.4亿元。
目前，医院脑外科开展的脑立体定向技术综合研究及颅脑导航手术在全国属领先地位，医院是卫生部全国立体定向技术培训基地。心内科在省内率先开展各种心血管病介入治疗，年介入治疗数省内领先。心外科已成功进行5例心脏移植手术，1例心肺联合移植，标着志医院心脏移植技术已进入国内先进行列。血液科开展各种造血干细胞移植工作，脐血移植治疗急性白血病达国内领先水平。普外科在省内率先开展活体肝移植，胰胆管镜技术全省领先。同时，各种微创介入技术在眼科、骨科、妇产科、耳鼻咽喉科、消化内科及呼吸内科广泛开展起来。医院重点扶持的以器官、人工合成物、组织细胞为基础的移植技术；以腔镜和内镜为代表的各种微创技术；以心血管疾病和肿瘤等为代表的介入技术；以各种危急重症的抢救技术；以细胞移植（包括生殖医学）和治疗技术为主的五大关键技术在多个科室蓬勃开展。妇产科的辅助生殖技术省内领先。
