区别：
一、拨款方式不同:
1、对于事业单位来说财政拨款的形式，
2、从拨款额度来分可分为全额拨款、差额拨款。
联系：
全额拨款与差额拨款相比那个好，这并没有统一的标准。主要还是与单位的实际联系在一起进行分析。
比如单位除财政拨款外没有其他的收入，或其他的收入很少，当然争取全额拨款好，这样人员的工资、基本奖金就有了保障。
如单位的其他收入很多，还是差额拨款好。因为差额拨款下，财政对单位的监控较少，单位自由度更大，这一点可是哪一本书上都没说过的。
财政拨款，各级人民政府对纳入预算管理的事业单位、社会团体等组织拨付的财政资金，但国务院和国务院财政、税务主管部门另有规定的除外。
要求
加强项目（课题）的合同、协议、计划任务书的规范管理。项目（课题）的合同、协议、计划任务书由科技处专人管理，无项目（课题）合同、协议、计划任务书，经费到位时财务处不得予以入帐或不予办理经费转拨，由此带来的费用开支，由该项目（课题）自行承担。
横向收入必须签定技术合同，并须经技术市场登记认证。若不办理技术市场登记认证手续，该项经费收入所需交纳的税款（流转税税率为5.5%，所得税税率为33%），由课题组自行承担。
参考资料来源：