哈药集团有限公司哈药集团拥有两个国家级企业技术中心、一个博士后科研工作站、一个省级药物制剂工程技术研究中心、一个省级抗生素工程技术研究中心，有正高职称、高级工程师及享受政府津贴人员共计566人。哈药集团创建了“一个中心五个分中心”的科研开发体系，哈药集团技术中心（生物工程研究中心）；抗感染药物研究中心；现代中药研究中心；药物制剂研究中心；OTC药品及保健食品研究中心；动物疫苗及兽药研究中心。哈药集团先后共有25个项目与清华大学、中国科学院、中国药科大学、沈阳药科大学等23个大专院校科研单位开展多方位的合作。
哈药集团所属的黑龙江省生物制品一厂与黑龙江省兽医研究所合作在厂内建立了研究中心；2003年末，哈药集团与哈尔滨医科大学（黑龙江省生物医药工程重点实验室）共建了哈医大哈药集团生物医药工程研发中心；哈药集团所属的黑龙江省生物制品一厂与中国农业科学院哈尔滨兽医研究所建立了战略联盟协作关系，成功引进国际首创的禽流感疫苗生产技术；药物制剂中心与美国归国博士共同组建固体、液体缓释控释靶向给药制剂平台，在2006年引进了优秀的脂肪乳剂方面的博士后，正在进行静脉乳剂的研究。注重人才引进和培养。为构筑集团科研人才高地，先后完成了与哈医大和东北林业大学搭建生物医药、与中医药大学搭建现代中药等高层次创新人才培养的平台，同时，充分利用博士后工作站有计划地为公司进行后备人才的培养。目前哈药集团攻读博士及硕士学位的科技人员有100多人，为哈药集团今后的发展提供了强有力的人才储备。 集团公司科技能力逐渐增强，先后承担国家及省、市级科研项目36项，其中包括两个国家“863”项目；2005年又承担了国家“十五”重大科技专项‘创新药物和中药现代化’专项（注射用刺五加研究）；国家技术中心创新能力建设项目（“真核细胞表达的重组蛋白技术研发创新能力”专题）及国家知识产权局专项研究（抗生素专利战略研究）等国家级科研课题。2001年——2005年获新产品批文100多个，其中国家级三类以上新药占20%。截至到2006年上半年，集团公司共150余个新产品待批或在研。
国家一类新药有6个，其中有三个正在进行临床试验，预计在2008年之前将获得生产批文。中药粉针剂属国内首创中药剂型，其产品技术先进性属世界领先。集团公司在国内率先掌握了抗生素原料药生产技术，通过持续技术攻关和新技术应用，主要技术指标大幅提高。推广青霉素新菌种，采用膜过滤、“三合一”等新技术，青霉素产率有大幅度提高，技术指标一直保持了国内领先水平。头孢唑林钠、阿莫西林钠生产技术水平属国际先进水平，生产技术指标处国内领先地位。化学制剂完成了由第一代：传统的片剂、胶囊、注射剂等，向第二代：缓释制剂、肠溶制剂等以控制释放速度为目的的转变。目前，集团公司已经开始了第三代：控释制剂、利用单克隆抗体、脂质体、微球等生物载体技术制备的靶向给药制剂的研究工作，并已取得了一定的成绩。集团公司先后成功研制开发的新型制剂技术品种有：肠溶制剂、缓释制剂及靶向制剂等20多个品种。
