南山实验学校麒麟中学部成立于2001年9月，位于南山区深南大道旁的义学路，紧邻区政府大楼，交通便利，是一所政府公办的省一级学校，致力于提供高标准的教育环境。学校占地21000平方米，建筑面积13400平方米，包含36间标准教室、12间教学辅助用室，以及体育设施如1个200米标准塑胶运动场、4个篮球场和多个球类场地，以及生态劳技园地，硬件设施完善且布局合理。
现有36个教学班，1200名学生和93名教职工，其中包括60多名特级教师、高级教师和优秀教育工作者。学校以信息技术与课程整合为特色，以“勤学、慎思、立善、创美”为校训，强调从严治校与科学管理，通过“礼仪教育”培养学生良好习惯，形成高效教学风格。
“育人先育心”，麒麟中学部注重学生品德教育，通过系统礼仪教育，塑造高尚、优雅的校园文化，为学生提供一个净化心灵、陶冶情操的学习环境。中学部以常规管理和教学质量闻名，已成为南山学子首选的求学之地。
而荔林中学部成立于2007年，坐落在大南山脚下，目前借光彩小学校舍办学。校园依山而建，设有25间标准教室和先进设施的图书馆、实验室等，提供优良学习环境。荔林中学秉持麒麟中学的教育理念，致力于创新和进取。
南头小学部创建于1932年，位于深圳市南山区中心地带，是南山实验集团的一部分，拥有27000平方米的建筑面积，环境优美，设施齐全，为学生提供了丰富的学习资源。南头部以培养目标为核心，致力于教育改革和教师队伍建设。
麒麟小学部在麒麟花园内，经过发展，设有24个教学班和先进的科技教育特色，注重学生的实践能力和综合素质培养。鼎太小学部则位于鼎太风华社区，具有欧式风格，提供多元化的教学设施和丰富的课外活动，旨在打造规范、特色与创新并重的现代化学校。
最后，麒麟幼儿部作为南山实验学校的附属幼儿园，注重幼儿全面发展，采用多元智能教育，致力于培养健康活泼、全面发展的小孩，是深圳市信息化教育的先锋。
深圳市南山实验学校前身为南头小学，创办于1932年，迄今走过了76年的历史。在其不平凡的创业与发展历程中，经历并实现了多次成功的跨越：1994年，成为了广东省第一批“省一级学校”，1998年被教育部确立为首批全国中小学现代教育技术实验学校，2001年更名南山实验学校，2002年被教育部确定为全国教育科学“十五”规划教育重点课题“网络教育的设计与评价研究“试验学校”。