台湾通行证在申请人户籍所在地的县级以上公安机关出入境管理机构办理。
一、办理程序为：
1、申请人向户口所在地公安机关出入境管理机构申请；
2、符合异地办理条件的，可以向居住地公安机关出入境管理机构申请办理。
二、根据《大陆公民往来台湾地区管理办法》第六条以及公安部出入境管理局制定的《大陆居民往来台湾通行证、签注审批签发管理工作规范》第一、二条规定：
1、大陆居民申请因私事前往台湾探亲、定居、访友、旅游、接受和处理财产，处理婚丧及其他私人事务，以及申请前往台湾进行本企业经贸交流活动：
由常住户口所在地的市、县公安机关出入境管理部门受理。
2、大陆居民申请应邀前往台湾进行经济、文化、科技、体育、学术等活动或者参加会议、进行两岸事务性商谈、采访，以及执行海峡两岸直航航运任务等：
常住户口所在地的直辖市或者地（市）级的公安机关出入境管理部门受理。
3、同时申请《往来台湾通行证》及前往台湾签注的：
由各省、自治区、直辖市公安厅（局）出入境管理部门集中制作、签发。
4、对持有有效《往来台湾通行证》申请前往台湾签注的：
由直辖市、地（市）级公安机关出入境管理部门签发。
扩展资料：
办理台湾通行证应准备的申请材料：
1、提交填写完整的《大陆居民往来台湾地区申请表》。
2、提交正面免冠蓝底彩色近照2张，规格为33×48mm。
3、交验身份证件。交验申请人有效居民身份证（未满16周岁的除外）、户口簿原件，并提交复印件。
定居国外的中国公民来大陆后申请前往台湾，由暂住地的公安机关出入境管理机构受理。须交验本人有效的《中华人民共和国护照》或《中华人民共和国旅行证》、定居国外的证明，并提交复印件。
代办的，交验代办人居民身份证原件，并提交复印件。
4、交验有效的入台许可证明，并提交复印件。
5、已持有效《大陆居民往来台湾通行证》的，提交证件原件。
6、单位意见。
登记报备的国家工作人员申请前往台湾，须提交所在工作单位意见。
持国务院台办“赴台批件”的人员申请前往台湾，无须提交所在工作单位意见。
7、提交与申请事由相应的证明材料。
（1）应邀前往台湾的，提交国务院台办“赴台批件”原件，或经省、自治区、直辖市政府台办确认盖章的复印件。
在非常住户口所在地申请的，提交工作证明，交验暂住证原件，并提交复印件。
由组团单位代办的，代办人须提交单位介绍信。
（2）经国务院台办经济局审核立项前往台湾进行经贸交流活动的，提交国务院台办经济局“关于应邀往来台湾立项批复”原件。
8、申请补发、换发证件，须提交下列有关证明：
（1）补发证件的，提交证件报失地公安机关出具的证明；
（2）换发证件的，提交原持有的《大陆居民往来台湾通行证》。证件损毁的，提交证件损毁说明书。
参考资料来源：百度百科——大陆居民往来台湾通行证
本回答被网友采纳一、本地户籍居民
（1）持台办 “赴台批件”的应邀赴台人员，可由工作所在地、组团单位所在地公安机关出入境管理机构受理
（2）执行两岸航运任务的大陆机组、船员赴台，须由航空、船舶公司所在地公安机关出入境管理机构受理
（3）大陆居民赴台旅游组团社领队申请团队旅游签注，须由组团社所在地公安机关出入境管理机构受理
（4）大陆渔船船员前往台湾从事对台近海渔工劳务合作作业，可由其所属劳务合作企业所在地公安机关出入境管理机构受理
（5）派驻香港、澳门特别行政区工作的大陆居民经批准应邀赴台，可分别由广东省深圳市、珠海市公安机关出入境管理机构受理
（6）大陆居民与台湾居民所生子女申请赴台湾定居，在大陆未办理户籍登记的，须由其生母（父）户籍所在地公安机关出入境管理机构受理
（7）军人申请前往台湾，须由部队或者工作单位驻地公安机关出入境管理机构受理
（8）居住证持有人以及其他符合国家移民管理局规定的在非常住户口所在地申请通行证件规定条件的，可以按相应规定由有关地方公安机关出入境管理机构受理
二、非本地户籍居民省内就近办理
可向居住地的公安机关出入境管理机构就近申请
赴台定居和赴台个人游签注（含海西区赴金马澎地区个人游签注），以及《办理往来台湾通行证及签注服务指引》中指定受理机构的情形除外
三、非本地户籍居民跨省异地办理
可向居住地的公安机关出入境管理机构就近申请
赴台定居签注，以及《办理往来台湾通行证及签注服务指引》中指定受理机构的情形除外
此外，须注意以下事项
（1）大陆居民跨省异地申请办理《往来台湾通行证件》及签注，不包括登记备案的国家工作人员
（2）大陆居民在居住地就近申请办理赴台个人旅签注，所居住城市应属于开放赴台个人游城市
（3）在全国实施居住证制度的县级以上城市，居住证持有人可在居住地就近申请往来台湾通行证及签注，须提交本人居民身份证、居住证，其他申请材料与当地户籍居民一致
四、其他可在居住地就近申请往来台湾通行证及签注的情形及所需材料
（1）31个城市符合条件的本市户籍居民的外地户籍配偶、未满16周岁子女，以及非本市户籍的就业、就学人员及其配偶、未满16周岁子女可在居住地就近提交大陆居民《往来台湾通行证》及签注申请
31个城市包括：北京、天津、石家庄、太原、呼和浩特、沈阳、大连、长春、哈尔滨、上海、南京、杭州、宁波、合肥、福州、厦门、南昌、济南、青岛、郑州、武汉、长沙、广州、深圳、南宁、海口、重庆、成都、贵阳、昆明、西安
（2）全国 60 周岁（含）以上大陆居民在非户籍地居住六个月以上的可在居住地提交大陆居民往来台湾通行证及签注申请
（3）大陆居民在非户籍地居住六个月以上的可在居住地提交换发、补发大陆居民往来台湾通行证以及再次赴台相同种类签注的申请
符合上述情形的大陆居民在非户籍地跨省异地办理往来台湾通行证及签注，须提交以下申请材料
本市户籍人员的非本市户籍的配偶、未满 16 周岁的子女，须提交双方亲属关系的证明材料
就业人员提交社保部门出具的在就业地连续一年以上缴纳社会保险的证明；就学人员提交就读院校出具的在学证明
上述人员的配偶、子女提交居住地公安机关出具的居住满 6 个月（含）以上的证明（居住证等），如其户口簿不能证明亲属关系，提交其他证明材料
60 周岁以上老人提交居住地公安机关出具的居住满六个月（含）以上的证明（《居住证》等）
申请补、换发《大陆居民往来台湾通行证》以及再次赴台同类签注的申请人提交居住地公安机关出具的居住满六个月（含）以上的证明（居住证等）
五、到现场办理之前可先在网上进行预约
通过「公安出入境网上办事平台」，点击“预约申请”选择本市进行业务申请
未满 16 周岁的申请人不允许在网上申请出入境业务，应在监护人陪同下前往出入境大厅申请
以上材料来源于
最好出发前至少一个月就要准备办理台湾通行证和入台证，否则无法按时出发。
办理《大陆居民往来台湾通行证》/签注，申请人自行前往户籍所在地出入境管理处办理 《大陆居民往来台湾通行证》自由行个人旅游签注(G 签)，一般为 15 个工作日，时间以各地要求为准，台湾通行证费用为30元（使用期限5年），签注每次20元。
2、交验申请人居民身份证、户口簿原件，提交复印件，申请人未满16周岁只需提交户口簿。
3、提交具有经营赴台旅游资质的组团旅行社出具的团队旅游办证名单。
4、旅游团领队申办证件及签注由其所在的组团社统一向组团社所在地公安机关出入境管理部门提出申请，并交验组团社出具的公函及赴台旅游领队证。其中异地申请的，由审批机关发函户口所在地公安机关核查相关情况后予以办理。
5、持证人遗失证件，向原受理申请的直辖市、地(市)级公安机关出入境管理部门申请补发，提交证件报失地警察机关出具的证明。
6、由本人到出入境管理部门提交申请，但申请人未满16周岁的由监护人陪同办理或代办，提交监护人身份证原件、复印件及能证明监护关系的相应资料;申请人年满70周岁可以委托直系亲属或其他监护人代办，须提交委托书、代办人身份证原件、复印件。
扩展资料
市民首次申领《大陆居民往来台湾通行证》，办证时限为15个工作日;如已持有《大陆居民往来台湾通行证》，仅办理赴台个人旅游签注的，办证时限为10个工作日。《大陆居民往来台湾通行证》每证80元，大陆居民往来台湾一次有效签注，每件15元，多次有效签注，每件80元。