求助帖？请问18S rRNA的Q-PCR引物是怎么设计的

如题所述

举报该问题

第1个回答 2017-08-01

18S的全称是ribosomal protein 18，你用这个找找能不能找到，一般来讲都会有的。而且，在NCBI上查找数据，先不要缩小查找范围，选择All Datebases 更好吧

相似回答

PCR引物怎么设计?答：1、引物的长度一般为15-30 bp，常用的是18-27 bp，但不应大于38，因为过长会导致其延伸温度大于74℃，不适于Taq DNA聚合酶进行反应。2、引物序列在模板内应当没有相似性较高，尤其是3’端相似性较高的序列，否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基，如GG...

pcr扩增的引物怎么设计答：1. 引物长度：引物的长度通常在18-30个核苷酸之间。较短的引物可能特异性不足，而较长的引物则可能导致引物间互补配对，形成引物二聚体，从而影响PCR效率。2. GC含量：GC含量（鸟嘌呤和胞嘧啶的含量）应在40%-60%之间。过高的GC含量可能导致引物在退火时形成稳定的非特异性配对，而过低的GC含量则可...

PCR引物设计怎么做啊?跪求!答：PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段，使其能有效地扩增模板DNA序列。因此，引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。要设计引物首先要找到DNA序列的保守区。同时应预测将要扩增的片段单链是否形成二级结构。如这个区域单链能形成二级结构，就要避开它。如这一段不能形成二级结构，那就可以...

怎样在NCBI的primerblast里设计Q-PCR的引物?答：方法/步骤 1、首先打开NCBI，选择“Nucleotide”，并在搜索框输入基因名。一般用目标基因的突变体1去设计引物，也就是要选择目标基因的“transcriptvariant1,mRNA”,没有1就用2、3，以此类推。因为是Q-PCR，所以要去掉内含子，因此用mRNA。2、从上一个页面点击FASTA，可以看到mRNA的序列。3、搜索“...

从真菌中提取出未知DNA,怎么设计引物来进行PCR扩增答：要知道是哪种真菌就好办了，找到这个真菌的英文名称（学名），到NCBI找这个真菌的18s的rDNA的DNA序列，根据这个序列用软件设计引物做PCR。如果不知道是哪种真菌，知道真菌属于哪个分类属的话，就根据这个属的18s的rDNA的DNA序列，设计简并引物做PCR，简并引物的退火温度要根据情况调低。

pcr引物设计的基本原则有哪些答：PCR引物设计的11条黄金法则 1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因，通过序列分析软件（比如DNAman）比对（Alignment），各基因相同的序列就是该基因的保守区。2.引物长度一般在15~30碱基之间。引物长度（primerlength...

...是怎么设计的?两个引物的关系以及在PCR中起的作用。答：PCR中，两个引物分别与目地DNA的2条子链的两端互补，也就是如果从图的平面来看：一个引物与上一条链的左端互补，另一个引物与下一条子链的右端互补。所以两个引物的序列是不相同的，这样才不会乱。引物的作用：有了引物分别与子链互补，那些单个的脱氧核苷酸才能够开始连接上去。

在RQ-PCR中,管家基因的引物应如何设置?谢谢答：housekeeping gene的引物设计与你想探测的目标基因引物设计方法相同，而且一般文献上都应该给出，遵照文献使用即可，一般问题都会出在目标基因的引物设计上。不过在q-PCR中，housekeeping gene 引物还需注意以下几点 1. 首先找到合适的housekeeping gene，其表达应具有一致可参考性。2. 引物长度在17-22bp。3...

用18s rRNA做RT-PCR的内参时,可以用oligo dT做反转录吗?答：这个是不行的，需要用random primers来做反转录引物。oligo dT适合真核生物的mRNA的反转录，而这个 rRNA不同于mRNA，没有polyA尾巴，因此用oligo dT是不能反转录出rRNA的。反转录过程由反转录酶催化，该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶（RDDP），即以RNA为模板催化DNA链的合成。合成的DNA链称为与RNA互补DNA...

大家正在搜

Q是谁 Q是啥 Q是 1Q 帖经三帖帖然谭念帖逃暑帖

新手求助关于荧光定量PCR引物设计问题

求助miRNA QRT-PCR引物设计

rt-pcr和pcr引物设计为什么会有不同

实时荧光定量pcr引物怎么设计

荧光定量PCR引物设计普通pcr引物设计和荧光定量pcr引...