通过对以色列平民的自杀性炸弹袭击，迫使以色列撤离约旦河西岸和加沙地带，建立独立的巴勒斯坦国，并最终消灭以色列。以色列前沙龙政府从加沙地带的撤军被哈马斯视为是自己军事策略的重大胜利。
1987年12月14日，巴勒斯坦被占领土爆发“石头起义”的时候宗教领导人艾哈迈德·亚辛提议成立“伊斯兰抵抗运动”.
1988年1月，“哈马斯”一词正式在伊斯兰抵抗运动的各种公告和各大媒体中出现。
1989年，以色列宣布哈马斯为非法组织，并将其精神领袖亚辛逮捕入狱。“9·11”事件后，美国和欧盟先后宣布哈马斯为“恐怖组织”，并冻结其财产。澳大利亚随后也宣布冻结哈马斯领导人的财产。
1993年，巴以双方在华盛顿签署了巴勒斯坦自治《原则宣言》，允许巴勒斯坦人在加沙-杰里科地区先行自治。哈马斯对此持反对态度，依然坚持对以色列的武装斗争。
1996年3月，哈马斯宣布将放弃暴力活动，在自治区内进行政治斗争。同年5月，内塔尼亚胡出任以色列总理后，在巴以和谈问题上采取强硬政策，致使巴以最后阶段谈判停滞。哈马斯宣布恢复武装斗争。
2000年9月底巴以大规模流血冲突爆发后，哈马斯制造了一系列针对以色列的自杀式爆炸事件。作为报复，以色列对哈马斯实施了“定点清除”和大规模的军事行动，使哈马斯遭受重创。亚辛以及他的接班人兰提西等哈马斯领导人先后被以色列“定点清除”。
2004年3月22日，亚辛在以色列发动的空袭中身亡。
2006年
1月25日，哈马斯在巴立法委员会选举中击败巴民族解放运动(法塔赫)，赢得选举胜利。
1月26日，哈马斯在巴勒斯坦第二次立法委员会选举中获得132个席位中的76席，远远超过其他党派(民族解放运动法塔赫获得43席)，其崛起对巴以局势构成严重冲击。3月28日，巴勒斯坦立法委员会宣布，哈马斯提交的新政府组建计划获得通过。
3月28日，哈马斯组建的巴自治政府宣誓就职。
5月11日，被关押在以色列监狱中的巴勒斯坦多个派别的领导人联名签署“狱中协议”，呼吁民族团结，组建民族联合政府，重组巴勒斯坦解放组织，实现在被占领土上建立巴勒斯坦国的目标。
6月25日，巴武装人员捕获一名以色列士兵。3天后，以军入侵加沙。5个月后，以军结束在加沙的军事行动。
6月27日，巴主要派别就 “狱中协议”达成共识。
8月16日，阿巴斯宣布，巴自治政府总理哈尼亚已经同意就根据“狱中协议”组建民族联合政府事宜与法塔赫及其他派别进行磋商。
10月1日，哈马斯武装人员与法塔赫支持者在加沙地带发生激烈冲突，致使8人死亡、70多人受伤。
12月1日，巴民族权力机构主席阿巴斯宣布，组建联合政府的谈判失败。
12月16日，阿巴斯在拉姆安拉发表讲话说，他已决定尽快要求提前举行立法委员会选举和民族权力机构主席选举。
2007年
2月8日，阿巴斯与哈马斯政治局领导人迈沙阿勒就建立民族团结政府、新政府政治纲领和重建巴勒斯坦解放组织等问题达成“麦加协议”。
2月15日，巴自治政府宣布解散，阿巴斯授权哈尼亚组建新政府。
3月17日，巴民族联合政府宣誓就职。
5月23日，在法塔赫和哈马斯再次爆发冲突两星期后，阿巴斯与哈尼亚举行会谈，商量如何停止两派之间的暴力冲突。
6月9日，哈马斯和法塔赫武装在加沙地带爆发激烈冲突，造成30多人伤亡。此后冲突日趋激化哈马斯用武力夺取了对加沙地带的控制权。。
6月14日，哈马斯从法塔赫手中夺取了加沙控制权。阿巴斯宣布解散民族联合政府，在约旦河西岸和加沙地带实施紧急状态。
6月15日，阿巴斯任命法耶兹为紧急政府总理。
6月17日以独立人士萨拉姆·法耶兹为总理的巴勒斯坦紧急政府宣誓就职，宣告成立刚3个月的巴民族联合政府正式解体。
2008年
6月，以哈马斯为主的加沙各武装派别与以色列达成了为期6个月的停火协议。
12月19日停火协议到期后，双方没有就延续停火协议达成一致。以哈马斯为主的加沙各武装派别认为，由于以方未能遵守承诺在停火期间解除对加沙地带的封锁以及停止对加沙地带的军事打击，以方应为停火协议到期未能延续负责。
12月27日，以色列空军向加沙地带的哈马斯目标发动大规模的空袭，致使至少230名巴勒斯坦人死亡，780多人受伤。
12月27日，以色列战机和武装直升机对哈马斯控制的加沙地带发动了大规模空袭，哈马斯发言人巴尔胡姆当日要求其下属武装派别对以色列发射远程火箭弹，以报复以军空袭加沙。 这次空袭是自1967年中东战争以来，以军袭击所造成的巴勒斯坦人单日死亡人数最多的一次。加沙地区应急机构负责人29日表示，以色列对哈马斯发动的空袭已造成310人死亡，另有1400余人受伤。巴勒斯坦27日宣布未来三天为哀悼日。
2011年12月14日在加沙城庆祝哈马斯成立24周年。巴勒斯坦伊斯兰抵抗运动(哈马斯)当日发表声明，称哈马斯成立24年来，共有1365名以色列人在哈马斯发起的行动中死亡，另有6411名以色列人受伤。哈马斯军事翼“卡桑旅”总计发动1117起针对以色列人的行动，包括87起自杀式袭击。24年间，哈马斯向以色列发射火箭弹总计11039枚。
2012年11月18日，以色列总理表示，以色列对加沙地带的军事行动将继续下去，并扩大规模。同时，哈马斯方面则提出了停火条件，由于哈马斯自以为在冲突中“占了上风”，所以对停火的要价很高：一是以色列解除对加沙的封锁，二是以色列承诺再不对加沙领导人“定点清除”。
2014年6月巴勒斯坦法塔赫与哈马斯两大派别就组建联合政府达成了协议，但法塔赫对加沙基本没有控制力和影响力，也无法配合哈马斯的抗以行动。以色列对哈马斯大打出手，其重要的目的是，警告阿巴斯领导的巴勒斯坦民族权力机构：与哈马斯联合没有出路。
7月27日哈马斯再攻击以色列，以军随即恢复轰炸加沙。以色列的军事打击，至今已夺走超过1000条性命。
