1862年1月1日,清政府总理衙门批准设立江汉关。
1922年11月4日,江汉关大楼举行奠基典礼。经过一年多的建设,于1924年1月21日举行落成典礼。
1930年,因岳州口岸贸易缩减,原岳州分关事务由江汉关办理。
1937年,长沙关撤销,所有未了事务及人员由江汉关办理。
1938年10月25日,武汉被日本侵略军占领,江汉关停止工作。
1945年8月10日,日本宣布投降后,江汉关于1945年9月26日恢复海关业务。
1949年5月26日,武汉市军事管制委员会海关贸易处接管江汉关。
1949年10月25日中央人民政府海关总署成立,江汉关直属海关总署领导。
1950年1月15日,江汉关改称中华人民共和国汉口关。
1950年10月16日,汉口关改名为武汉关。
1953年1月15日,改称中华人民共和国武汉关。
1956年,由于当时我国对外贸易形势发生变化,武汉关于5月1日奉令对外公告撤销。
1980年3月28日,经国务院批准,武汉海关正式成立。
1984年6月9日,国务院批准武汉海关调整为厅局级机构。