全电子发票开票流程主要包括申请开具、发票开具、发票验真和发票归档四个环节。
一、申请开具全电子发票
企业需要先向税务局申请开具全电子发票，申请方式包括网上申请和到税务局申请。申请成功后，企业将获得一张纳税人识别号码和一张电子发票专用章。
二、发票开具
开具发票前，企业需要通过税局提供的发票开具软件对销售商品进行录入，并选择开具发票的种类，包括普通发票、专用发票、电子发票等。
填写发票内容，包括购买方名称、纳税人识别号、地址、电话等信息，同时填写销售商品的名称、数量、单价、金额、税率等信息。填写完毕后，将发票内容上传到发票开具软件中。
确认发票信息，检查无误后，将发票内容提交给税务局进行审核。审核通过后，发票内容将被加密并生成一个唯一的发票代码和发票号码。发票开具完成后，企业将发票内容打印并盖上电子发票专用章，以便后续的验真和存档。
三、发票验真
发票验真是指企业对所开具的发票进行真实性的核查。企业可以通过税务局官方网站或者发票验真APP进行发票真伪的查询。在验真时，需要核对发票代码、发票号码、购买方纳税人识别号、开票日期、开票金额等信息是否与实际开具的发票相符。
四、发票归档
企业需要将开具的全电子发票以电子形式进行归档。归档的目的是为了便于以后的查阅和管理。企业可以将发票保存在企业内部的电脑或者服务器上，也可以将发票上传至云端进行存储。
电子发票的优点
发行电子发票将大幅节省企业在发票上的成本，节约发票印制成本，而且不包括企业发票管理间接成本。而且电子发票系统可以与企业内部的ERP、CRM、SCS等系统相结合，发票资料全面电子化并集中处理，有助于企业本身的账务处理，并能及时给企业经营者提供决策支持。
电子发票在保管、查询、调阅时更加方便，也便于电子商务网站为消费者提供更加方便的服务。而且可以减少纸质发票的资源浪费现象，将减少森林的砍伐，更加的环保，符合未来人类的发展。