你好！依照法律规定，是不能直接从其工资里扣除的。员工的工资是员工应得的劳动报酬，不得随意克扣。公司多交的社保，追究起来，应当是员工不当得利，可以要求返还。但二者在性质上不同，且前者确定，已届清偿期；后者尚不确定（是否属于不当得利，要由法院判决。）二者不可直接抵消。
附：相关法律法规条文
《工资支付暂行规定》
第十五条 用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；
（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
以上回答，希望能够对你有所帮助！
追问谢谢哇