南京军区总医院的科研力量强大，尤其在普通外科和肾病领域拥有世界级的专家。黎介寿院士，作为中国工程院院士，是普通外科研究所的所长，他毕业于前国立中正医学院，对国际外科学会和消化道外科学会有所贡献，担任多个医学院的兼职教授和导师，取得了多项国家科技进步奖和军队科技进步奖，以卓越的外科技术和科研成果闻名。
黎磊石院士在肾病领域同样享有盛誉，他是肾脏病研究所所长，国际肾脏病学会的创始人之一，发明了雷公藤治疗肾炎等疗法，多项创新技术让他在国际上享有极高声誉，曾荣获终身荣誉会员称号。刘志红院士则是肾脏病内科学专家，她的研究成果丰富，发表论文众多，对糖尿病肾病和IgA肾病的治疗有独到见解，曾获多项国家级科技进步奖和中国工程院院士的殊荣。
在妇产科领域，索晓萍副主任医师是苏州同济不孕不育医院的特聘专家，拥有20余年的临床经验，擅长习惯性流产和生殖内分泌疾病。赖爱鸾特聘专家擅长妇科疾病手术，尤其是微创技术治疗女性不孕，发表多篇专业论文，是妇科疾病治疗领域的权威。
杨建华博士园专家，作为中国生殖医学实验室的开创者，拥有丰富的国际交流经验，主编专业书籍，对男女不孕不育症的诊疗具有高度评价。任付全口腔美容大师，拥有扎实的口腔临床和教学经验，专长于国际先进的牙体牙髓病和前牙美容修复技术。
南京军区南京总医院是一所医教研协调发展的大型综合性医院，简称“（南京）军区总院”。南京大学医学院临床学院，第二军医大学等校的教学医院。1994年首批被评为“三级甲等医院”，1999年获得“全国百佳医院”称号，2000年经人事部批准，在全国医院系统首家设立博士后科研工作站，2002年被批准独立招收博士后。2003年7月，医院内科学、外科学被国务院学位委员会、教育部批准为博士学位授予权学科。同年医院荣获“全国拥政爱民模范单位”称号。2004年成为军队博士后管理信息中心。