湖南省防汛抗旱指挥部办公室的综合处主要承担以下职责：
协助领导管理日常事务，协调各部门工作
负责防汛抗灾的对外宣传
负责公文的处理，包括收发、流转和归档
管理指挥部和办公室印章，保障保密与安全
组织防汛、抗旱业务培训
承担公务接待和会务组织
协调法律法规、政策、制度的衔接工作
负责办公室财务管理及后勤服务
与防汛抢险部队保持联系
处理领导交办的其他工作
调度处的职责包括：
制定全省水库汛期运用方案并监督实施
编制防洪预案，管理分蓄洪区设施并参与防洪调度
组织防汛安全检查和隐患处理
参与防洪规划编制和水域管理
维护和管理防汛抗旱指挥系统平台
负责防汛值班室和会商室管理
提出应急除险水利建设资金分配建议并监督使用
处理领导交办的其他工作
减灾处专注于：
城市防洪工作
重大险情上报与处理
洪涝灾害统计与评估
防汛物资调度
抗旱经费分配建议与监督
防汛专用车辆管理
其他领导交办任务
抗旱处负责抗旱准备、新技术推广、旱情分析和指导全省抗旱服务组织。
应急处（挂有省水利厅反恐办、应急办）职责包括：
山洪灾害防治规划和实施
防汛组织机构建设和责任制落实
小型水库防汛工作
省水利厅反恐办与应急办日常工作
其他领导交办事项
防汛机动抢险队主要负责沅江基地管理、省级防汛物资储备和专业队伍的日常培训。