一、目的不同
内部牵制制度，对实现各职能部门与企业员工的牵制、制约具有重要的推动作用；
内部控制的主要目的是风险控制。
二、相互作用
内部牵制是内部控制的一部分，能够强化企业内部的相互监督工作,能大大减少企业内部由于管理漏洞产生的违法违纪问题，净化企业的内部管理环境；
内部控制立足于国情和企业现状，围绕企业发展战略、业务流程、风险点和控制点、信息化要求等多方面，以防范风险、有效监管为目的，基于管理提升，全方面、全方位和多体系的对企业经营各环节实行全面风险管理。
三、为管理而效力
内部牵制是企业进行账目间的相互核对工作并实施企业内部岗位分离制度，以确保企业账目的完整性和准确性；
内部控制更符合企业管理提升的要求。