截至2014年12月，学校有教职工2500多人（含两所附院），其中副高以上职称人员500余人。国医大师1人，皖江学者·讲席教授2人，博士生导师22人，硕士生导师333人；享受国务院特殊津贴35人、省政府特殊津贴5人；安徽省学术与技术带头人、后备人才18人；国家名老中医学术经验项目指导老师26人；国家级教学团队2个、省级教学团队2个。有来自中国国内外的56名知名专家学者担任该校客座教授。
国医大师：徐经世 教学团队 团队名称带头人获评年份级别中医基础理论教学团队王键2009年国家级中药学专业教学团队彭代银2010年国家级中医临床技能教学团队王金萍、李保启 2010年 省级中医临床基础教学团队储全根2010年省级资料来源： 学校1978年开始招收硕士研究生，1981年首批获硕士学位授权，1999年开始联合培养博士研究生，2008年获得开展硕士研究生推荐免试资格，2013年被教育部批准为博士学位授予单位。
截至2014年12月，学校有2个一级学科博士学位授予点，4个一级学科硕士学位授予点、25个二级学科硕士学位授予点、4个硕士专业学位授权点，5个博士生联合培养基地。有17个国家中医药管理局重点建设学科、1个省级重中之重学科，12个省级重点建设学科，7个卫生部国家临床重点专科，21个国家中医药管理局重点建设专科、23个安徽省中医药重点专科。
一级学科博士学位授予点：中医学、中药学
一级学科硕士学位授予点：中医学、中药学、中西医结合、药学
硕士专业学位授权点：临床医学、中药学、药学、工程（制药工程） 安徽中医药大学省部级以上重点学科一览表序号学科名称学科级别批准时间1 中医肺病学 国家中医药重点学科 2002年9月
2009年12月 2 中医基础理论 国家中医药重点学科 2009年12月 3 中医痹病学 国家中医药重点学科 2009年12月 4 中医内分泌病学 国家中医药重点学科 2009年12月 5 针灸学 国家中医药重点学科 2009年12月 6 药用植物学 国家中医药重点学科 2009年12月 7 中医史学 国家中医药重点学科 2012年8月 8 中医疮疡病学 国家中医药重点学科 2012年8月 9 中医养生学 国家中医药重点学科 2012年8月 10 中医老年病学 国家中医药重点学科 2012年8月 11 中药化学 国家中医药重点学科 2012年8月 12 临床中药学 国家中医药重点学科 2012年8月 13 中西医结合临床 国家中医药重点学科 2012年8月 14 中医药信息学 国家中医药重点学科 2012年8月 15 中医传染病学 国家中医药重点学科 2012年8月 16 中医“治未病”学 国家中医药重点学科 2012年8月 17 中医文化学 国家中医药重点学科 2012年8月 18 中医学 安徽省重点学科（A类）
安徽省学科建设重大项目 2008年9月
2013年11月 19 中药学 安徽省重点学科（B类）
安徽省学科建设重大项目 2008年9月
2014年8月 20 中医内科学 安徽省重点学科（B类） 1996年9月
2002年1月
2008年9月 21 针灸推拿学 安徽省重点学科（B类） 2002年1月
2008年9月 22 中医基础理论 安徽省重点学科（B类） 2008年9月 23 中医妇科学 安徽省重点学科（B类） 2008年9月 24 中西医结合临床 安徽省重点学科（B类） 2008年9月 25 中西医结合基础 安徽省重点学科（B类） 2008年9月 26 中医诊断学 安徽省重点学科（B类） 2012年7月 27 中药药理学 安徽省重点学科（B类） 2012年7月 28 药剂学 安徽省重点学科（B类） 2012年7月 29 方剂学 安徽省重点学科（B类） 2012年7月 30 中医外科学 安徽省重点学科（B类） 2012年7月 资料来源： 安徽中医药大学是国家中医临床研究基地、国家中药现代化科技产业（安徽）基地、国家中医药国际合作基地、国家药品临床研究基地、硕士研究生推荐免试单位。2005年以良好成绩通过国家教育部本科教学工作水平评估，2009年学校以优异成绩通过国家教育部中医学专业试点认证。 质量工程 截至2014年12月，学校有国家教育部高等学校特色专业5个、省级特色专业3个、安徽省教学改革示范专业4个，1门国家级精品课程、16门省级精品课程。有2个国家级精品资源共享课程，1个国家级实验实训示范中心，3个省级实验实训示范中心，1个省级人才培养创新试验区。
2009——2014年，学校先后获国家级、省级质量工程项目100余项，国家级教学成果奖2项、省级教学成果特等奖2项、一等奖7项。学校还举办了新安医学教改实验班，在临床专业建立客观化结构考试中心。
国家教育部高等学校特色专业：中医学、针灸推拿学、中西医临床医学、中药学、药学
省级特色专业：应用心理学、中西医临床医学、药学
安徽省教学改革示范专业：中药学、中医学、康复治疗学、国际经济与贸易（医药贸易）
省级人才培养创新试验区：校-师承教育与区域特色相结合的中医学人才培养模式创新实验区
国家级实验实训示范中心：中药类实验教学中心
省级实验实训示范中心：药学类专业综合技能示范实习实训中心、临床技能综合实训及OSCE中心、针灸康复实验实训中心
国家级精品资源共享课程：中医基础理论、方剂学 省级精品课程 课程名称所属院系负责人获评年份中药药剂学药学院桂双英2013医学统计学中西医结合临床学院朱继民2013宏微观经济学医药经济管理学院陶群山2013药物分析药学院吴虹2013护理学基础护理学院肖洪玲2013中医妇科学一附院李伟莉2012药理学中西医结合临床学院龙子江2012预防医学基础中西医结合临床学院朱继民2015方剂学中医临床学院章健2013微生物学中西医结合临床学院汪长中2012人体解剖学中西医结合临床学院申国明2012温病学中医临床学院刘兰林2012人体寄生虫学中西医结合临床学院汤冬生2015内经中医临床学院沈津湛2015资料来源： 学生培养 2010年开始与长春、福建2所中医药大学开展相互交流培养学生；设立大学生课外科技创新与创业基金；开展“百人获奖、千人参与、万人受益”的大学生知识技能竞赛和“挑战杯”等各级各类竞赛活动；广泛开展各类社会实践活动。2008—2013年学校共有学生200余人次在学术科技与创新创业领域获省部级以上表彰和奖励70余项（其中获全国大学生管理决策模拟大赛特等奖1次、全国“挑战杯”大学生创业计划竞赛三等奖1次、全国“挑战杯”大学生课外学术科技作品竞赛三等奖2次）。2008年——2014年，学校毕业生平均就业率在94%以上，连续获得安徽省普通高校就业工作“先进集体”或“标兵单位”称号。 截至2014年12月，学校有3所直属附属医院（第一附属医院、第二附属医院、第三附属医院）、4所非直属附属医院。
其中第一附属医院是全省最大的三级甲等综合性中医医院；第二附属医院是全国首家三级甲等针灸专科医院；第三附属医院是国家第三批重点建设的中西医结合医院，神经病学研究所附属医院是一所以“肝豆状核变性诊治”为优势的专科医院，国医堂是一所为广大患者以纯中医方式为主要医疗手段的医疗单位。 截至2014年12月，学校与美国、澳大利亚等26个国家和地区的41个医疗和教育机构建立了友好合作关系。1994年获准招收国外留学生，先后有20多个国家和地区的学员来校攻读硕士、学士学位以及临床研修。与美国、瑞典、新加坡、日本、韩国及港澳台地区的院校开展学者互访和学生交流活动。
此外，学校与黄山、亳州、绩溪、舒城等市县人民政府签订全面合作协议，与河南宛西、江苏康缘、深圳三九等中国国内知名中医药企业签订战略合作协议，建有亳州济人药业等25个产学研合作基地，开展50多项技术服务。
