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    • 使用R语言对SSR数据做主成分分析（PCA）的一个简单小例子

    如题所述

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    第1个回答  2022-06-11
    示例数据来自于R语言包 poppr ,csv文件存储，数据格式如下

    使用到的是R语言的 poppr 包中的 read.genalex() 函数
    poppr 第一次使用需要先安装

    读入数据

    读入数据直接是 genclone object，使用函数 genclone2genind() 将其转换成genind object，接下来使用 ade4 包中的 dudi.pca() 函数做主成分分析

    主成分的结果存储在li中

    还是认为的分个组，然后做散点图

    明天的推文再继续这部分内容吧！
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