医疗机构设置的基本原则包括：
法律分析：1、有设置医疗机构的批准书；
2、符合医疗机构的基本标准；
3、有适合的名称、组织机构和场所；
4、有与其开展的业务相适应的经费、设施、设备和专业卫生技术人员；
5、有相应的规章制度；
6、能够独立承担民事责任。
法律依据：《医疗机构管理条例》
第二条 本条例适用从事疾病诊断、治疗活动的医院、卫生院、疗养院、门诊部、诊所、卫生所（室）以及急救站等医疗机构。
第三条 医疗机构以救死扶伤，防病治病，为公民的健康服务为宗旨。
第四条 国家扶持医疗机构的发展，鼓励多种形式兴办医疗机构。
第五条 国务院卫生行政部门负责全国医疗机构的监督管理工作。
法律分析：医疗机构设置应当遵循以下原则：
(一)公平性原则。医疗卫生服务必须坚持公平、公正原则，要从当地的医疗供需实际出发，面向城乡，以基层为重点，充分发挥现有医疗资源的作用，适当调控城市医疗机构的发展规模，保证全体居民尤其是广大农民都能公平、公正地享有基本医疗服务;
(二)整体效益原则。医疗机构设置应当符合当地卫生发展总体规划的要求，建立各级各类医疗机构相互协调和有序竞争的医疗服务体系，局部要服从全局，科学合理配置医疗资源，充分发挥医疗服务体系的整体功能和效益，避免诱导以趋利为目的、争夺病人的无序甚至恶性竞争的发生;
(三)可及性原则。各级各类医疗机构服务半径的规划、确定要适宜，交通便利，布局合理，易于群众得到服务;
(四)分级医疗原则。落实医疗机构的功能和职责，建立和完善分级医疗、双向转诊的医疗服务体系，做到常见病、多发病在基层医疗机构诊疗，危重急症和疑难病在城市医院诊疗;
(五)公有制主导原则。坚持非营利性医疗机构为主体、营利性医疗机构为补充，公立医疗机构为主导、非公立医疗机构共同发展的办医原则，鼓励和引导社会资本发展医疗卫生事业，促进非公立医疗卫生机构发展，形成投资主体多元化、投资方式多样化的办医体制。
(六)中西医并重原则。遵循卫生工作的基本方针，中西医并重，保证中医、中西医结合、民族医医疗机构的合理布局及资源配置。
法律依据：《医疗机构管理条例》 第三条 医疗机构以救死扶伤，防病治病，为公民的健康服务为宗旨。