从我国人口与健康的重大需求出发，在生殖生物学中亟待发展的男性生殖健康研究领域里，以重要的雄性生殖器官－－附睾为研究系统，引进功能基因组、蛋白质组等研究的新思路和新方法，集中研究附睾中与精子成熟等过程相关的基因和蛋白质，旨在揭示附睾在精子成熟、储存和防御等过程中作用的分子机制，为雄性生殖调控理论的发展和突破作出贡献，并为男性避孕药的研制、男性不育症的诊断治疗和日趋严重的性疾病传播防治等方面提供理论指导。
该实验室由张友端教授在1978年建立。
她于1989年退居二线作顾问后，由其学生张永莲教授担任课题组长。由于这是我国第一个从事这一飞速发展的领域的研究室。因此他们首先建立了各种激素受体的测定方法，并以培训班的形式向全国推广，以填补我国这一领域在研究和临床应用方面的空白。然后进行了雌激素受体的纯化，制备单克隆抗体等基础工作。同时筛选了研究激素作用原理的靶基因系统，通过对大鼠前列腺中PSBP基因表达的时空秩序以及雄激素影响下的特征，证明了它是研究雄激素对真核基因转录的调控机制的一个理想系统。通过对PSBP的C3基因启动子上的顺式调控元件和细胞核中的反式作用因子相互作用的研究，发现了启动子上的一些重要元件如：TATA盒和CCAAT盒上除了有一些通用因子与之作用外，还有组织特异的和雄激素调控相关的因子与之直接或间接地结合然后起协同作用。这些成果获得了1993年的中国科学院的自然科学一等奖，1997年国家自然科学三等奖。
为了深入了解多元件，多因子的相互作用中的调控激发程序，该课题组进而开始研究基因转录活性与染色体结构的关系。此外，为了将基础研究与生物学重大问题相结合，他们已开始研究睾丸生精过程中及附睾对精子成熟过程中的基因表达程序的调控，以期能为男性健康生育调控的药物设计提供新的思路。近4年来,在猴与大鼠中就取得了15个新基因的全长cDNA)和27个新cDNA片段均被NIH基因库收录(猴的工作与美国北卡大学合作)，而且分别在附睾的不同部位表达。这样一大批新基因的发现为双方附睾研究打下了坚实的基础。特别是最近发现其中在附睾头部上皮细胞特异表达的一个大鼠新基因Bin1b与生育相关、联合了香港中文大学陈小章教授,用他们的附睾上皮细胞培养系统证明了它确实是一个天然抗菌肽，这是第一个被发现的与附睾内在防御系统相关的基因。相关论文在今2001年3月2日出版的Science上发表。继而又发现它被分泌入管腔后与精子结合，使精子摄取到足够量的钙后，起始精子运动。
相关论文在2004年5月2日网络版的 Nature Cell Biology上发表。目前正联合所内外力量,优势互补,在此基础上趁胜追击,为我国附睾与精子相关的功能基因组学和男性节育和不育作出更大的贡献. 实验室已经和国际上的许多实验室有合作课题，遍及美国，英国，澳大利亚，香港地区。目前，课题经费来源有：参与国家973项目，中国科学院知识创新重要方向项目，美国CONRAD和NIH Fogarty国际合作项目。
