使用R语言和ggplot2绘制分组散点图、截断坐标轴、添加四分位数图和进行显著性检验的步骤如下：
读取数据集：
使用read.csv或read.table等函数读取包含表达值和分组信息的数据集。
计算四分位数：
使用quantile函数计算每个分组内的四分位数信息。
绘制分组散点图：
使用ggplot函数创建基础散点图。使用aes函数映射x轴和y轴变量，并设置颜色或形状区分不同分组。使用geom_point函数添加散点。
截断坐标轴：
手动设置轴范围：使用scale_x_continuous或scale_y_continuous函数中的limits参数手动设置坐标轴的显示范围。使用ggbreak包：安装并加载ggbreak包，使用ggbreak::geom_break函数在指定位置添加坐标轴截断。
添加四分位数图：
使用geom_errorbar或geom_crossbar函数为每个分组添加表示四分位数的误差棒或交叉线。设置ymin和ymax参数为四分位数范围，x参数为对应的表达值。
进行显著性检验：
使用R中的统计检验函数对分组间的表达值进行显著性检验。将检验结果添加到图表中，可以使用annotate函数添加文本注释，或使用ggsignif包添加显著性标记。
注意事项： 在绘图前，确保数据集已正确读取并预处理。 根据数据特点选择合适的显著性检验方法。 在添加四分位数图和进行显著性检验时，确保坐标轴截断不影响结果的准确表达。 使用ggtheme等函数可以进一步美化图表，提高可读性。