Fisher 精确检验与卡方检验(10X单细胞和10X空间转录组的基础知识)

如题所述

第1个回答  2022-07-07

举个例子:

零假设: 颜值跟成绩无显著相关性。

第一步: 想知道零假设是否成立,就要看这组数据是不是随机偶然一抽就能抽到,因此我们计算零假设成立时,即颜值高与颜值低的人,高分低分的数量相同时,得到这样一组数据的 超几何概率

第二步: 做完上面这一步还不够。如果行总数与列总数(又叫边际总数)不变,零假设不成立时的极端情况应该是,颜值高的学习都好!那么我们可以得到新的列联表:

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Python中我们用scipy模块 scipy.stats.chi2_contingency 来计算卡方及其P值:

1.所有的理论数T≥5并且总样本量n≥40,用Pearson卡方进行检验.
2.如果理论数T<5但T≥1,并且n≥40,用连续性校正的卡方进行检验.
3.如果有理论数T<1或n<40,则用Fisher’s检验.

https://www.zhihu.com/question/28637406

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